RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 HCRTR2O43614 444 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 RAD51DO75771 328 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 APOC3P02656 99 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 SH3BP2P78314 561 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 UGT3A2Q3SY77 523 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 OR52B6Q8NGF0 335 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 KATNBL1Q9H079 304 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 C2orf74A8MZ97 194 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 GSRP00390 522 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 F2P00734 622 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 FPGSQ05932 587 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 KBTBD6Q86V97 674 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.1■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 ANHXE9PGG2 379 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 PTTG1O95997 202 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR4P46093 362 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 PROKR1Q8TCW9 393 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 HS6ST2Q96MM7 605 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 FEVQ99581 238 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 LMAN2Q12907 356 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 IFNL1Q8IU54 200 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL21Q9UJP4 597 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKCAP17252 672 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 MTFR2Q6P444 385 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 METTL25Q8N6Q8 603 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 UCHL1P09936 223 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM234Q8WY98 164 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 F2RL3Q96RI0 385 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRTM2O43300 516 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 HEXBP07686 556 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 PRMT2P55345 433 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 MAPK15Q8TD08 544 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 HRASLS2Q9NWW9 162 aa23.09■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 IL33O95760 270 aa23.08■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 AMY2BP19961 511 aa23.08■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 STK19P49842 368 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM225Q6GV28 225 aa23.08■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa23.08■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 EGFL6Q8IUX8 553 aa23.08■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 NME4O00746 187 aa23.08■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNJ5P48544 419 aa23.08■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM217AQ8IXS0 508 aa23.08■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF649Q9BS31 505 aa23.08■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 FAIMQ9NVQ4 179 aa23.08■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa23.08■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 ACBD7Q8N6N7 88 aa23.08■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC22A8Q8TCC7 542 aa23.08■■□□□ 1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 SOD2P04179 222 aa23.08■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 AGTR1P30556 359 aa23.08■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 RING1Q06587 406 aa23.08■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 LAS2Q8IYD9 372 aa23.08■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ARL14Q8N4G2 192 aa23.08■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 IRF7Q92985 503 aa23.08■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 RETREG1Q9H6L5 497 aa23.08■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ERVK-19Q9WJR5 959 aa23.08■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 FEZF1A0PJY2 475 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 CD3GP09693 182 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ARL3P36405 182 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF792Q3KQV3 632 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 NXPE4Q6UWF7 544 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 DLK2Q6UY11 383 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 CLECL1Q8IZS7 167 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 OR6C4Q8NGE1 309 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 HUS1BQ8NHY5 278 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 NDNFQ8TB73 568 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 TCEAL3Q969E4 200 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SGTBQ96EQ0 304 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 NLKQ9UBE8 527 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 EDARQ9UNE0 448 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 FMO6PO60774 539 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 S100PP25815 95 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 GATMP50440 423 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 PXYLP1Q8TE99 480 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD60Q9BZ19 345 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 EMC3Q9P0I2 261 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 MAS1P04201 325 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 HRH2P25021 359 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 COMMD7Q86VX2 200 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 PCYT2Q99447 389 aa23.07■■□□□ 1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 CLEC3AO75596 197 aa23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms