RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF549Q6P9A3 640 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SH2D5Q6ZV89 423 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 C9orf40Q8IXQ3 194 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF321PQ8N8H1 164 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SPPL2AQ8TCT8 520 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf54Q8WWF1 131 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2E3Q969T4 207 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 PGM2Q96G03 612 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS39Q96JC1 886 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 HS6ST2Q96MM7 605 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4K3Q96R72 315 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBA1CQ9BQE3 449 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 RHNO1Q9BSD3 238 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 WWTR1Q9GZV5 400 aa7.16□□□□□ -1.26
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PGGT1B-201ENST00000296642 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR41Q9HAD4 459 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 PHF11Q9UIL8 331 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CFL2Q9Y281 166 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 MED16Q9Y2X0 877 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CLDN16Q9Y5I7 305 aa7.16□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 DOCK7Q96N67 2140 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A087X1B8 175 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 GRID2IPA4D2P6 1211 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC22A20A6NK97 555 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 GNB5O14775 395 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 HAUS5O94927 633 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR47O94967 919 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV3-11P04433 115 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ETS1P14921 441 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TBXA2RP21731 343 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 DEKP35659 375 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SSR2P43308 183 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 NAGLUP54802 743 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 DSCR9P59020 149 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS13P62277 151 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 HERVK_113P63132 956 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVK-8P63133 956 aa7.15□□□□□ -1.26
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PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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PGGT1B-201ENST00000296642 EIPR1Q53HC9 387 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ABHD17CQ6PCB6 329 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 LYPD8Q6UX82 237 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TCAIMQ8N3R3 496 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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PGGT1B-201ENST00000296642 BBOF1Q8ND07 529 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC44A1Q8WWI5 657 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 RIT1Q92963 219 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINB12Q96P63 405 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CSF3RQ99062 836 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 EFCAB11Q9BUY7 163 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVK-6Q9BXR3 956 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL4Q9C0H6 718 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 SPNS1Q9H2V7 528 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 EHD1Q9H4M9 534 aa7.15□□□□□ -1.26
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PGGT1B-201ENST00000296642 RNF112Q9ULX5 631 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 PROCRQ9UNN8 238 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVK-19Q9WJR5 959 aa7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PGGT1B-201ENST00000296642 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 PLOD2O00469 737 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ST8SIA5O15466 376 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 EMC8O43402 210 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 LRATO95237 230 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.14□□□□□ -1.27
PGGT1B-201ENST00000296642 CD8BP10966 210 aa7.14□□□□□ -1.27
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