RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 TAPBPO15533 448 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 OSMP13725 252 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 EDNRAP25101 427 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 CD70P32970 193 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 PRKCZQ05513 592 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 HYAL2Q12891 473 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 BTN1A1Q13410 526 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 PLBD1Q6P4A8 553 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 AMZ2Q86W34 360 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 ZNF740Q8NDX6 193 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 CEP76Q8TAP6 659 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 PRDM9Q9NQV7 894 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 GNG8Q9UK08 70 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 PPT2Q9UMR5 302 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 LAMB1P07942 1786 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 AOC2O75106 756 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 LEFTY1O75610 366 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 KCNK2O95069 426 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 CLCN7P51798 805 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 FOXRED2Q8IWF2 684 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 POMGNT2Q8NAT1 580 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 TANKQ92844 425 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 NDC1Q9BTX1 674 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 TRIM36Q9NQ86 728 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 KCNK6Q9Y257 313 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 EOMESO95936 686 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 ARL4DP49703 201 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 SLC14A1Q13336 389 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 CDK10Q15131 360 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 HYLS1Q96M11 299 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 CDCP1Q9H5V8 836 aa14.96□□□□□ -0.01
USP43-201ENST00000285199 SPTBP11277 2137 aa14.96□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 ANXA2P2A6NMY6 339 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 NDUFS4O43181 175 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 PIP5K1CO60331 668 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 RPL35P42766 123 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 CEBPGP53567 150 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 PRKCDQ05655 676 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 LIPJQ5W064 366 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 KDM4DQ6B0I6 523 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 XKRXQ6PP77 449 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 NUDT18Q6ZVK8 323 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 VRK3Q8IV63 474 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 RTP3Q9BQQ7 232 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 BTBD1Q9H0C5 482 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 POT1Q9NUX5 634 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 OR6C2Q9NZP2 312 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 FBXO10Q9UK96 956 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 FABP7O15540 132 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 TGM1P22735 817 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 PDHA2P29803 388 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 CSNK1DP48730 415 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 EFR3AQ14156 821 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 GDPD1Q8N9F7 314 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 OR52N2Q8NGI0 321 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 CXorf40BQ96DE9 158 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 HOXD1Q9GZZ0 328 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 TAS2R10Q9NYW0 307 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 MGAT4CQ9UBM8 478 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 UBQLN2Q9UHD9 624 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 ECDO95905 644 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 CBSLP0DN79 551 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 GIFP27352 417 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 CBSP35520 551 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 RING1Q06587 406 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 CPOQ8IVL8 374 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 SLITRK4Q8IW52 837 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 COX18Q8N8Q8 333 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 COQ10AQ96MF6 247 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 ADAM12O43184 909 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 HRGP04196 525 aa14.95□□□□□ -0.02
USP43-201ENST00000285199 GYPBP06028 91 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms