RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 ADGRF1Q5T601 910 aa20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 BCL2L15Q5TBC7 163 aa20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 TMEM207Q6UWW9 146 aa20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 CALHM3Q86XJ0 350 aa20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 SFT2D1Q8WV19 159 aa20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 AP3S1Q92572 193 aa20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 EXT2Q93063 718 aa20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 KCNC2Q96PR1 638 aa20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 OR2M2Q96R28 347 aa20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 GAL3ST1Q99999 423 aa20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ACTL8Q9H568 366 aa20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 POMT2Q9UKY4 750 aa20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 ARL5AQ9Y689 179 aa20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PITX1-201ENST00000265340 MEIKINA0A087WXM9 373 aa20.83■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 STARP49675 285 aa20.83■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 MXD1Q05195 221 aa20.83■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 DSG2Q14126 1118 aa20.83■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 PLA1AQ53H76 456 aa20.83■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 SHFQ7M4L6 423 aa20.83■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 NLRC3Q7RTR2 1065 aa20.83■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa20.83■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 GBF1Q92538 1859 aa20.83■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 DNTTIP1Q9H147 329 aa20.83■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 CERS4Q9HA82 394 aa20.83■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 CLDN11O75508 207 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 UROSP10746 265 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 CXCL3P19876 107 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 DMC1Q14565 340 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 OPCMLQ14982 345 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 BEND4Q6ZU67 534 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 FAM217AQ8IXS0 508 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 MGME1Q9BQP7 344 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 MED18Q9BUE0 208 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 OR51M1Q9H341 326 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 SLC6A5Q9Y345 797 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 INSL5Q9Y5Q6 135 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 WRBO00258 174 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 S100PP25815 95 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 PPM1AP35813 382 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 KIAA0040Q15053 153 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 MSRB3Q8IXL7 192 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 CAMKVQ8NCB2 501 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 OR6P1Q8NGX9 317 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 SMIM14Q96QK8 99 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 OR51J1Q9H342 316 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 REEP1Q9H902 201 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 DLL4Q9NR61 685 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 MS4A12Q9NXJ0 267 aa20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 KDELR3O43731 214 aa20.81■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 FABP3P05413 133 aa20.81■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 RHOCP08134 193 aa20.81■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 ADRA2AP08913 450 aa20.81■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 HSPA7P48741 367 aa20.81■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 TXNDC8Q6A555 127 aa20.81■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 CNIH2Q6PI25 160 aa20.81■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 LRRC46Q96FV0 321 aa20.81■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 TRIB3Q96RU7 358 aa20.81■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 SLC38A3Q99624 504 aa20.81■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 IL21Q9HBE4 155 aa20.81■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 NDUFB11Q9NX14 153 aa20.81■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa20.81■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 A0A0G2JPF8 293 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 RASGRP1O95267 797 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 F11P03951 625 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 MTHFD2P13995 350 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 SMSP52788 366 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 MADCAM1Q13477 382 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 ZNF425Q6IV72 752 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 PYHIN1Q6K0P9 492 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 ZER1Q7Z7L7 766 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 CILP2Q8IUL8 1156 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 TCEAL8Q8IYN2 117 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 RAD51AP1Q96B01 352 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 SFXN2Q96NB2 322 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 PTDSS2Q9BVG9 487 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 CDCP1Q9H5V8 836 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa20.8■□□□□ 0.92
PITX1-201ENST00000265340 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms