RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 C7orf34Q96L11 122 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PHOX2BQ99453 314 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CLEC4EQ9ULY5 219 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ITM2BQ9Y287 266 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 NPC1O15118 1278 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PGRMC2O15173 223 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TPST2O60704 377 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ACP5P13686 325 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 GJA8P48165 433 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TAP2Q03519 686 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 COX20Q5RI15 118 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 LIPKQ5VXJ0 399 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 VITQ6UXI7 678 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ABHD13Q7L211 337 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HORMAD2Q8N7B1 307 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF366Q8N895 744 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR4K5Q8NGD3 323 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SLC9A6Q92581 669 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 IL17FQ96PD4 163 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CSF3RQ99062 836 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 LINC00597Q9H2U6 94 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 IL23AQ9NPF7 189 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ACER3Q9NUN7 267 aa8.4□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PRODHO43272 600 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TIMP1P01033 207 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 INHBBP09529 407 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ACRP10323 421 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RPS5P46782 204 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 C3orf38Q5JPI3 329 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 DESI1Q6ICB0 168 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SYCE2Q6PIF2 218 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SORCS1Q8WY21 1168 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PDXPQ96GD0 296 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 LRR1Q96L50 414 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D17Q9HA65 648 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD36A6QL64 1941 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZAR1LA6NP61 321 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PTHP01270 115 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PEPDP12955 493 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HOXA9P31269 272 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ACSL1P33121 698 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RAB28P51157 221 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 DPTQ07507 201 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PDE7AQ13946 482 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 KLHL12Q53G59 568 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 AGAP6Q5VW22 663 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF614Q8N883 585 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 AGAP4Q96P64 663 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 C17orf62Q9BQA9 187 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MS4A8Q9BY19 250 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 COMMD3Q9UBI1 195 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ICKQ9UPZ9 632 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 DAPL1A0PJW8 107 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MASP1P48740 699 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 GRIN2CQ14957 1233 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 IER5LQ5T953 404 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CLDN22Q8N7P3 220 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CAMKVQ8NCB2 501 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 NUP43Q8NFH3 380 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR5K2Q8NHB8 316 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TMEM163Q8TC26 289 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 POF1BQ8WVV4 589 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SGCDQ92629 289 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 DPH7Q9BTV6 452 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PLXNA3P51805 1871 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ARHGAP33O14559 1287 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 AK1P00568 194 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HTR1AP08908 422 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FSHRP23945 695 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 AVPR1BP47901 424 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 KCNJ5P48544 419 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SLAMF1Q13291 335 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR5AR1Q8NGP9 310 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF671Q8TAW3 534 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms