RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 MAGEB17A8MXT2 336 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SOCS5O75159 536 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 PDYNP01213 254 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 DNTTP04053 509 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 PIRTP0C851 137 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 RAB4AP20338 218 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SLC6A4P31645 630 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 PREPP48147 710 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SLC11A2P49281 568 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 PON3Q15166 354 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 TCTN1Q2MV58 587 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 FBXO48Q5FWF7 155 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ANXA8L1Q5VT79 327 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 LIPJQ5W064 366 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 RAB11FIP2Q7L804 512 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 TRIM69Q86WT6 500 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SCN4BQ8IWT1 228 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 NANPQ8TBE9 248 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SLC30A2Q9BRI3 323 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SLC12A9Q9BXP2 914 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 GSDMCQ9BYG8 508 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 GSX2Q9BZM3 304 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 BTBD1Q9H0C5 482 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 PIGUQ9H490 435 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 BRF2Q9HAW0 419 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SMURF1Q9HCE7 757 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 DYRK4Q9NR20 520 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 DNAJC11Q9NVH1 559 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SEC14L4Q9UDX3 406 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 DUSP12Q9UNI6 340 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 H7C2Y5 167 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ARVCFO00192 962 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 FPGTO14772 594 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 PROM1O43490 865 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 PGLSO95336 258 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 CD160O95971 181 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 HLA-DQB1P01920 261 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 HRGP04196 525 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 FGF2P09038 288 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ARSBP15848 533 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 CD96P40200 585 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 PGDP52209 483 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ATP12AP54707 1039 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 PSPHP78330 225 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 HMGCS1Q01581 520 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SLC14A1Q13336 389 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 GTF2H3Q13889 308 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 COTL1Q14019 142 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 UGT8Q16880 541 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SERPINA9Q86WD7 417 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 BTN2A2Q8WVV5 523 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ESAMQ96AP7 390 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ULK4Q96C45 1275 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 COQ8BQ96D53 544 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SIPA1Q96FS4 1042 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 TCEAL7Q9BRU2 100 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 MCOLN1Q9GZU1 580 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 TMEM38AQ9H6F2 299 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SLC25A19Q9HC21 320 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ITM2CQ9NQX7 267 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 PRKAB1Q9Y478 270 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 V9GYH0 126 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 GFRA2O00451 464 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 GPR37O15354 613 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF682O95780 498 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SCG5P05408 212 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 RHOCP08134 193 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ENGP17813 658 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 GRK5P34947 590 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 CTNNB1P35222 781 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 CCT3P49368 545 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 CRYBA2P53672 197 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ACTR1AP61163 376 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 LSM3P62310 102 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 FAM189BP81408 668 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 ARF5P84085 180 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 STX4Q12846 297 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 CLN3Q13286 438 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 NFATC2Q13469 925 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 DGCR6Q14129 220 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 WSCD2Q2TBF2 565 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 DGKKQ5KSL6 1271 aa5.99□□□□□ -1.45
SGIP1-201ENST00000237247 C10orf120Q5SQS8 335 aa5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.2 ms