RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 SLC34A3Q8N130 599 aa7.59□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.59□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 LOXL2Q9Y4K0 774 aa7.59□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.59□□□□□ -1.2
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NANOG-201ENST00000229307 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
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NANOG-201ENST00000229307 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
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NANOG-201ENST00000229307 GPR75O95800 540 aa7.58□□□□□ -1.2
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NANOG-201ENST00000229307 RPS9P46781 194 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
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NANOG-201ENST00000229307 TMPPEQ6ZT21 453 aa7.58□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ZNF534Q76KX8 674 aa7.58□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 GALNT5Q7Z7M9 940 aa7.58□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 LGI4Q8N135 537 aa7.58□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 OSTF1Q92882 214 aa7.58□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 GUCD1Q96NT3 240 aa7.58□□□□□ -1.2
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NANOG-201ENST00000229307 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.58□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PRKAR1AP10644 381 aa7.58□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 IFI30P13284 250 aa7.58□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 STAT5AP42229 794 aa7.58□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 SSR4P51571 173 aa7.58□□□□□ -1.2
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NANOG-201ENST00000229307 OR6K6Q8NGW6 343 aa7.58□□□□□ -1.2
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NANOG-201ENST00000229307 DOHHQ9BU89 302 aa7.58□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 OR51V1Q9H2C8 321 aa7.58□□□□□ -1.2
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NANOG-201ENST00000229307 SARDHQ9UL12 918 aa7.58□□□□□ -1.2
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NANOG-201ENST00000229307 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.58□□□□□ -1.2
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NANOG-201ENST00000229307 CAPGP40121 348 aa7.57□□□□□ -1.2
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NANOG-201ENST00000229307 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.57□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PIGWQ7Z7B1 504 aa7.57□□□□□ -1.2
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NANOG-201ENST00000229307 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.57□□□□□ -1.2
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