RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637223.1

CLN6-218, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN6, Length 652 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-218ENST00000637223 NARFQ9UHQ1 456 aa22.17■■□□□ 1.14
CLN6-218ENST00000637223 VAMP4O75379 141 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN6-218ENST00000637223 GYS1P13807 737 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN6-218ENST00000637223 C4AP0C0L4 1744 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN6-218ENST00000637223 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN6-218ENST00000637223 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN6-218ENST00000637223 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN6-218ENST00000637223 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CLN6-218ENST00000637223 ATP10DQ9P241 1426 aa22.14■■□□□ 1.14
CLN6-218ENST00000637223 FKBP8Q14318 412 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 CAMTA2O94983 1202 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 HSPA6P17066 643 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 COPS6Q7L5N1 327 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 STK31Q9BXU1 1019 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 HYPKQ9NX55 129 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 MMP10P09238 476 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 SLC4A2P04920 1241 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 HLFQ16534 295 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN6-218ENST00000637223 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 SCN7AQ01118 1682 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 NFIXQ14938 502 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 TM4SF1P30408 202 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 DDR1Q08345 913 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 G2E3Q7L622 706 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.04■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 BCORQ6W2J9 1755 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.03■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 RGL2O15211 777 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.02■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
CLN6-218ENST00000637223 GPTP24298 496 aa22.01■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 FLIIQ13045 1269 aa22.01■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.01■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 SETDB2Q96T68 719 aa22.01■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
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CLN6-218ENST00000637223 ZNF428Q96B54 188 aa22■■□□□ 1.11
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CLN6-218ENST00000637223 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.99■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.99■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 ADCY9O60503 1353 aa21.99■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.99■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 FAM177BA6PVY3 158 aa21.98■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.98■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.97■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 TCIRG1Q13488 830 aa21.97■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.97■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.97■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.97■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.97■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.97■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 KSR2Q6VAB6 950 aa21.96■■□□□ 1.11
CLN6-218ENST00000637223 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.95■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.95■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 MYD88Q99836 296 aa21.95■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.95■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 NPHP1O15259 732 aa21.94■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 SUSD4Q5VX71 490 aa21.93■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.93■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 CNBD1Q8NA66 436 aa21.93■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.92■■□□□ 1.1
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CLN6-218ENST00000637223 KIF3CO14782 793 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 PARP10Q53GL7 1025 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 NLRP10Q86W26 655 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.92■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.91■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 NUP98P52948 1817 aa21.9■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.9■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 BCAR3O75815 825 aa21.9■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.9■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.9■■□□□ 1.1
CLN6-218ENST00000637223 PTPRCP08575 1304 aa21.89■■□□□ 1.1
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