RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630804.2

SPTAN1-222, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5 BASIC

Gene SPTAN1, Length 7,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-222	ENST00000630804	CA8	P35219	290 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SPTAN1-222	ENST00000630804	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SPTAN1-222	ENST00000630804	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SPTAN1-222	ENST00000630804	GMNN	O75496	209 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SPTAN1-222	ENST00000630804	HYPK	Q9NX55	129 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SPTAN1-222	ENST00000630804	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		9.46	□□□□□ -0.89
SPTAN1-222	ENST00000630804	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.89
SPTAN1-222	ENST00000630804	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.89
SPTAN1-222	ENST00000630804	HMGXB3	Q12766	1538 aa		9.46	□□□□□ -0.89
SPTAN1-222	ENST00000630804	FCHSD2	O94868	740 aa		9.46	□□□□□ -0.89
SPTAN1-222	ENST00000630804	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.89
SPTAN1-222	ENST00000630804	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		9.46	□□□□□ -0.89
SPTAN1-222	ENST00000630804	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		9.46	□□□□□ -0.89
SPTAN1-222	ENST00000630804	RAB34	Q9BZG1	259 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	SWAP70	Q9UH65	585 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	SETSIP	P0DME0	302 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	SLF2	Q8IX21	1173 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	YEATS4	O95619	227 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	SIL1	Q9H173	461 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	EPSTI1	Q96J88	318 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	CCDC63	Q8NA47	563 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	CAMK4	Q16566	473 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	PLVAP	Q9BX97	442 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	STIM2	Q9P246	746 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	CCDC174	Q6PII3	467 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	CEP57	Q86XR8	500 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	TMX1	Q9H3N1	280 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	JADE2	Q9NQC1	790 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	ANO10	Q9NW15	660 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	SRGAP3	O43295	1099 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	KIF5B	P33176	963 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	CD109	Q6YHK3	1445 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	NAA25	Q14CX7	972 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	WDR78	Q5VTH9	848 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	TOP2B	Q02880	1626 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	KIF20A	O95235	890 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	SNX16	P57768	344 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	NGLY1	Q96IV0	654 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	KIF14	Q15058	1648 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	IVL	P07476	585 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	AACS	Q86V21	672 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	TACC1	O75410	805 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	KIF5A	Q12840	1032 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	SYCE3	A1L190	88 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	WHAMM	Q8TF30	809 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	CUL7	Q14999	1698 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	IQGAP2	Q13576	1575 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	METTL24	Q5JXM2	366 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	SYNC	Q9H7C4	482 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	AIDA	Q96BJ3	306 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	PRC1	O43663	620 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	TCHP	Q9BT92	498 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	NES	P48681	1621 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	ABCF2	Q9UG63	623 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	ERCC3	P19447	782 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	FLII	Q13045	1269 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	CCDC14	Q49A88	953 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	LIG1	P18858	919 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPTAN1-222	ENST00000630804	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9

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