RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627383.2

FHL1-222, Transcript of four and a half LIM domains 1, human

TSL 4

Gene FHL1, Length 566 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FHL1-222	ENST00000627383	CNBD1	Q8NA66	436 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	NUP98	P52948	1817 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	RGL2	O15211	777 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	RNF181	Q9P0P0	153 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	11.31	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	KIF3C	O14782	793 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	CEP350	Q5VT06	3117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	LMNB1	P20700	586 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	11.29	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	CNKSR1	Q969H4	720 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	SLX4	Q8IY92	1834 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	TOMM70	O94826	608 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	HSPA6	P17066	643 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	RIPK4	P57078	832 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	SOGA3	Q5TF21	947 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	STYK1	Q6J9G0	422 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	NBPF15	Q8N660	670 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	MASTL	Q96GX5	879 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	11.28	□□□□□ -0.6
FHL1-222	ENST00000627383	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	RASSF7	Q02833	373 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	ERBB4	Q15303	1308 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	C21orf2	O43822	256 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	NGEF	Q8N5V2	710 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	NYX	Q9GZU5	481 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	SRGN	P10124	158 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	NPR1	P16066	1061 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	FAM177B	A6PVY3	158 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	NFKBIE	O00221	500 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	MYL6B	P14649	208 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	APLP1	P51693	650 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	RUNDC1	Q96C34	613 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	RRAGC	Q9HB90	399 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	GLTPD2	A6NH11	291 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	ALDH1B1	P30837	517 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	FSTL1	Q12841	308 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	NEUROD2	Q15784	382 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	HLF	Q16534	295 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	ERFE	Q4G0M1	354 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	CCDC93	Q567U6	631 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	PARP10	Q53GL7	1025 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FHL1-222	ENST00000627383	WDR90	Q96KV7	1748 aa		11.21	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	GPT	P24298	496 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FHL1-222	ENST00000627383	SCN4A	P35499	1836 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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