RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614825.4

DDB2-208, Transcript of damage specific DNA binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene DDB2, Length 852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2-208ENST00000614825 LMOD3Q0VAK6 560 aa15.24■□□□□ 0.03
DDB2-208ENST00000614825 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa15.24■□□□□ 0.03
DDB2-208ENST00000614825 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
DDB2-208ENST00000614825 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
DDB2-208ENST00000614825 CLEC4GQ6UXB4 293 aa15.23■□□□□ 0.03
DDB2-208ENST00000614825 C21orf2O43822 256 aa15.22■□□□□ 0.03
DDB2-208ENST00000614825 HLFQ16534 295 aa15.22■□□□□ 0.03
DDB2-208ENST00000614825 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.22■□□□□ 0.03
DDB2-208ENST00000614825 NECTIN2Q92692 538 aa15.22■□□□□ 0.03
DDB2-208ENST00000614825 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
DDB2-208ENST00000614825 ADAMTS8Q9UP79 889 aa15.22■□□□□ 0.03
DDB2-208ENST00000614825 RUNDC1Q96C34 613 aa15.21■□□□□ 0.03
DDB2-208ENST00000614825 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.21■□□□□ 0.03
DDB2-208ENST00000614825 NMRK2Q9NPI5 230 aa15.21■□□□□ 0.03
DDB2-208ENST00000614825 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa15.21■□□□□ 0.03
DDB2-208ENST00000614825 BCORQ6W2J9 1755 aa15.21■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 KDM3BQ7LBC6 1761 aa15.21■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 KIF3CO14782 793 aa15.2■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 TPTE2Q6XPS3 522 aa15.2■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.2■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa15.19■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 LMNB1P20700 586 aa15.19■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 GPTP24298 496 aa15.19■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 CNKSR1Q969H4 720 aa15.19■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 MASTLQ96GX5 879 aa15.19■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.19■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 ANXA1P04083 346 aa15.18■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 DLEC1Q9Y238 1755 aa15.18■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.17■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 KDM2BQ8NHM5 1336 aa15.17■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 SRGNP10124 158 aa15.17■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 STYK1Q6J9G0 422 aa15.17■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 NUTM1Q86Y26 1132 aa15.17■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.16■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 NFKBIEO00221 500 aa15.16■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 KRT24Q2M2I5 525 aa15.16■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 RRAGCQ9HB90 399 aa15.16■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.16■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 PRELPP51888 382 aa15.15■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 PROSER3Q2NL68 480 aa15.15■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 NYXQ9GZU5 481 aa15.15■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 BABAM1Q9NWV8 329 aa15.15■□□□□ 0.02
DDB2-208ENST00000614825 TOMM70O94826 608 aa15.14■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 NPR1P16066 1061 aa15.14■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 HSPA6P17066 643 aa15.14■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 ERFEQ4G0M1 354 aa15.14■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 TAOK3Q9H2K8 898 aa15.14■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 SBF1O95248 1867 aa15.14■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 CACNA1SQ13698 1873 aa15.14■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 ERBB4Q15303 1308 aa15.14■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 APAF1O14727 1248 aa15.13■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 RGL2O15211 777 aa15.13■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 CHL1O00533 1208 aa15.12■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 PDIA6Q15084 440 aa15.12■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 SOGA3Q5TF21 947 aa15.12■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 SUSD4Q5VX71 490 aa15.12■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 OLFM4Q6UX06 510 aa15.12■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 COPS6Q7L5N1 327 aa15.12■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.12■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 ZNF428Q96B54 188 aa15.12■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 SLX4Q8IY92 1834 aa15.12■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 UBN2Q6ZU65 1347 aa15.12■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 ABCC12Q96J65 1359 aa15.11■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 CCDC93Q567U6 631 aa15.11■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.11■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 NUP98P52948 1817 aa15.1■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa15.1■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 GLTPD2A6NH11 291 aa15.1■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 ALDH1B1P30837 517 aa15.1■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 DPY19L2Q6NUT2 758 aa15.1■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa15.1■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.1■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 CHPF2Q9P2E5 772 aa15.1■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 CCDC184Q52MB2 194 aa15.09■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 CFAP44Q96MT7 982 aa15.09■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.09■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 MBIPQ9NS73 344 aa15.09■□□□□ 0.01
DDB2-208ENST00000614825 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
DDB2-208ENST00000614825 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
DDB2-208ENST00000614825 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
DDB2-208ENST00000614825 NTSR2O95665 410 aa15.08■□□□□ 0
DDB2-208ENST00000614825 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
DDB2-208ENST00000614825 PARP10Q53GL7 1025 aa15.08■□□□□ 0
DDB2-208ENST00000614825 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.08■□□□□ 0
DDB2-208ENST00000614825 LRP10Q7Z4F1 713 aa15.08■□□□□ 0
DDB2-208ENST00000614825 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
DDB2-208ENST00000614825 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
DDB2-208ENST00000614825 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
DDB2-208ENST00000614825 TIAM2Q8IVF5 1701 aa15.08■□□□□ 0
DDB2-208ENST00000614825 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
DDB2-208ENST00000614825 RTKN2Q8IZC4 609 aa15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms