RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598020.3

PNKP-211, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 3

Gene PNKP, Length 534 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-211ENST00000598020 ARXQ96QS3 562 aa26.19■■□□□ 1.78
PNKP-211ENST00000598020 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.18■■□□□ 1.78
PNKP-211ENST00000598020 CACNA1FO60840 1977 aa26.18■■□□□ 1.78
PNKP-211ENST00000598020 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.17■■□□□ 1.78
PNKP-211ENST00000598020 MMP10P09238 476 aa26.17■■□□□ 1.78
PNKP-211ENST00000598020 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.17■■□□□ 1.78
PNKP-211ENST00000598020 COPS6Q7L5N1 327 aa26.16■■□□□ 1.78
PNKP-211ENST00000598020 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.16■■□□□ 1.78
PNKP-211ENST00000598020 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.16■■□□□ 1.78
PNKP-211ENST00000598020 NFIXQ14938 502 aa26.15■■□□□ 1.78
PNKP-211ENST00000598020 STK31Q9BXU1 1019 aa26.15■■□□□ 1.78
PNKP-211ENST00000598020 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 NUP98P52948 1817 aa26.13■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 DDR1Q08345 913 aa26.12■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 HLFQ16534 295 aa26.12■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.12■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 ZNF428Q96B54 188 aa26.12■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.12■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 SLC4A2P04920 1241 aa26.1■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.1■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.1■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 ATP10DQ9P241 1426 aa26.1■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.09■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 SETDB2Q96T68 719 aa26.09■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.08■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
PNKP-211ENST00000598020 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.08■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.07■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.07■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 SERPINB2P05120 415 aa26.06■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.06■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.06■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.06■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.06■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 TCIRG1Q13488 830 aa26.04■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 G2E3Q7L622 706 aa26.04■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.04■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 FLIIQ13045 1269 aa26.03■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.03■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 SYT17Q9BSW7 474 aa26.03■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.03■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 KSR2Q6VAB6 950 aa26.02■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.02■■□□□ 1.76
PNKP-211ENST00000598020 PARP10Q53GL7 1025 aa26.01■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.01■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.01■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 SSH1Q8WYL5 1049 aa26■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.99■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.99■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.99■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.99■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 ADCY9O60503 1353 aa25.98■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.98■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 GPTP24298 496 aa25.98■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.98■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 CNBD1Q8NA66 436 aa25.97■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 NYXQ9GZU5 481 aa25.97■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.97■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 TGFB2P61812 414 aa25.96■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 SUSD4Q5VX71 490 aa25.96■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.96■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 NLRP10Q86W26 655 aa25.96■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 KLHL34Q8N239 644 aa25.96■■□□□ 1.75
PNKP-211ENST00000598020 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.94■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.94■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 NTSR2O95665 410 aa25.93■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 ST5P78524 1137 aa25.93■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.93■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.93■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.93■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.93■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 PTPRCP08575 1304 aa25.92■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 MYD88Q99836 296 aa25.92■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.91■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.91■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 NPHP1O15259 732 aa25.91■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.91■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.91■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.91■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.91■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.9■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 FAM177BA6PVY3 158 aa25.9■■□□□ 1.74
PNKP-211ENST00000598020 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.9■■□□□ 1.74
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