RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-208ENST00000597576 HACL1Q9UJ83 578 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-208ENST00000597576 TLL2Q9Y6L7 1015 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-208ENST00000597576 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-208ENST00000597576 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-208ENST00000597576 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-208ENST00000597576 USPL1Q5W0Q7 1092 aa10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-208ENST00000597576 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-208ENST00000597576 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-208ENST00000597576 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-208ENST00000597576 BCL2L12Q9HB09 334 aa10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-208ENST00000597576 SPG7Q9UQ90 795 aa10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-208ENST00000597576 LAMA3Q16787 3333 aa10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-208ENST00000597576 SCN7AQ01118 1682 aa10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-208ENST00000597576 H0YIN7 160 aa10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-208ENST00000597576 RALBP1Q15311 655 aa10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-208ENST00000597576 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 RNF123Q5XPI4 1314 aa10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 SERPINB2P05120 415 aa10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 IFNL2Q8IZJ0 200 aa10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 CLEC11AQ9Y240 323 aa10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 COL4A5P29400 1685 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 ERVV-2B6SEH9 535 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 ANP32CO43423 234 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 GRM1Q13255 1194 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 SAPCD2Q86UD0 394 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 CFAP53Q96M91 514 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 VCANP13611 3396 aa10.44□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 CIAPIN1Q6FI81 312 aa10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 C7orf43Q8WVR3 580 aa10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 HHIPL1Q96JK4 782 aa10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 ZIC5Q96T25 663 aa10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 NARFQ9UHQ1 456 aa10.43□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 TRAF5O00463 557 aa10.42□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 DLL1O00548 723 aa10.42□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 ZPR1O75312 459 aa10.42□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 NBPF15Q8N660 670 aa10.42□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 UBR2Q8IWV8 1755 aa10.42□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 SNED1Q8TER0 1413 aa10.41□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 COL15A1P39059 1388 aa10.41□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 FZD9O00144 591 aa10.41□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP10.41□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 EYA1Q99502 592 aa10.4□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 BRIP1Q9BX63 1249 aa10.4□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa10.4□□□□□ -0.74
ZNF548-208ENST00000597576 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 GPC2Q8N158 579 aa10.39□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 POLKQ9UBT6 870 aa10.39□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 NUDCQ9Y266 331 aa10.39□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 SRGNP10124 158 aa10.38□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 PDE6BP35913 854 aa10.38□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 SOGA3Q5TF21 947 aa10.38□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 PRR5LQ6MZQ0 368 aa10.38□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 SAGE1Q9NXZ1 904 aa10.38□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 HPS5Q9UPZ3 1129 aa10.38□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.38□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa10.37□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 MTHFSP49914 203 aa10.37□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 SCNN1DP51172 638 aa10.37□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 STYK1Q6J9G0 422 aa10.37□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 CNKSR1Q969H4 720 aa10.37□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 PPP2R1AP30153 589 aa10.36□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP10.36□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 NOGQ13253 232 aa10.36□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 DNAJC10Q8IXB1 793 aa10.36□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 NEFMP07197 916 aa10.35□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 EPS15P42566 896 aa10.35□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 OLFM4Q6UX06 510 aa10.35□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC24Q8N4L8 307 aa10.35□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa10.35□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 MRC1P22897 1456 aa10.35□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 CELF2O95319 508 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC93Q567U6 631 aa10.34□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 TBC1D9BQ66K14 1250 aa10.34□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa10.34□□□□□ -0.75
ZNF548-208ENST00000597576 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
ZNF548-208ENST00000597576 IARSP41252 1262 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
ZNF548-208ENST00000597576 CABP4P57796 275 aa10.33□□□□□ -0.76
ZNF548-208ENST00000597576 MASTLQ96GX5 879 aa10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms