RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597020.5

AP2S1-204, Transcript of adaptor related protein complex 2 subunit sigma 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AP2S1, Length 707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1-204ENST00000597020 PRKAR2BP31323 418 aa23.72■■□□□ 1.39
AP2S1-204ENST00000597020 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.72■■□□□ 1.39
AP2S1-204ENST00000597020 MASTLQ96GX5 879 aa23.72■■□□□ 1.39
AP2S1-204ENST00000597020 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.72■■□□□ 1.39
AP2S1-204ENST00000597020 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.72■■□□□ 1.39
AP2S1-204ENST00000597020 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.7■■□□□ 1.38
AP2S1-204ENST00000597020 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.7■■□□□ 1.38
AP2S1-204ENST00000597020 SCN4AP35499 1836 aa23.69■■□□□ 1.38
AP2S1-204ENST00000597020 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
AP2S1-204ENST00000597020 SRGNP10124 158 aa23.69■■□□□ 1.38
AP2S1-204ENST00000597020 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.69■■□□□ 1.38
AP2S1-204ENST00000597020 POTECB2RU33 542 aa23.68■■□□□ 1.38
AP2S1-204ENST00000597020 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
AP2S1-204ENST00000597020 USP16Q9Y5T5 823 aa23.68■■□□□ 1.38
AP2S1-204ENST00000597020 KCNQ3O43525 872 aa23.67■■□□□ 1.38
AP2S1-204ENST00000597020 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
AP2S1-204ENST00000597020 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
AP2S1-204ENST00000597020 RGL2O15211 777 aa23.65■■□□□ 1.38
AP2S1-204ENST00000597020 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
AP2S1-204ENST00000597020 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
AP2S1-204ENST00000597020 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.65■■□□□ 1.38
AP2S1-204ENST00000597020 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.64■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 CHADLQ6NUI6 762 aa23.64■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 NPR1P16066 1061 aa23.63■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 CCDC93Q567U6 631 aa23.63■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 TNS4Q8IZW8 715 aa23.63■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 NEFMP07197 916 aa23.62■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.62■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.61■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 MCM10Q7L590 875 aa23.61■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 CREBZFQ9NS37 354 aa23.61■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 NUP98P52948 1817 aa23.6■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 ALDH1B1P30837 517 aa23.59■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.58■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 PPP2R1AP30153 589 aa23.58■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.58■■□□□ 1.37
AP2S1-204ENST00000597020 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.57■■□□□ 1.36
AP2S1-204ENST00000597020 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
AP2S1-204ENST00000597020 LDHDQ86WU2 507 aa23.56■■□□□ 1.36
AP2S1-204ENST00000597020 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
AP2S1-204ENST00000597020 NYXQ9GZU5 481 aa23.55■■□□□ 1.36
AP2S1-204ENST00000597020 NBPF26B4DH59 902 aa23.54■■□□□ 1.36
AP2S1-204ENST00000597020 DCTN1Q14203 1278 aa23.54■■□□□ 1.36
AP2S1-204ENST00000597020 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
AP2S1-204ENST00000597020 NBPF15Q8N660 670 aa23.54■■□□□ 1.36
AP2S1-204ENST00000597020 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.53■■□□□ 1.36
AP2S1-204ENST00000597020 FAM177BA6PVY3 158 aa23.53■■□□□ 1.36
AP2S1-204ENST00000597020 CAPN15O75808 1086 aa23.53■■□□□ 1.36
AP2S1-204ENST00000597020 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
AP2S1-204ENST00000597020 POTEIP0CG38 1075 aa23.52■■□□□ 1.36
AP2S1-204ENST00000597020 POTEJP0CG39 1038 aa23.52■■□□□ 1.36
AP2S1-204ENST00000597020 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
AP2S1-204ENST00000597020 HACL1Q9UJ83 578 aa23.52■■□□□ 1.36
AP2S1-204ENST00000597020 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.51■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 HLFQ16534 295 aa23.5■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.5■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.5■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.49■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 SYNE4Q8N205 404 aa23.49■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 JDP2Q8WYK2 163 aa23.49■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 PASKQ96RG2 1323 aa23.49■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.48■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.48■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 CNTNAP1P78357 1384 aa23.48■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 FZD9O00144 591 aa23.47■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 NGEFQ8N5V2 710 aa23.47■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 PSMD1Q99460 953 aa23.47■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.47■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 EPHX2P34913 555 aa23.46■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.46■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 GPC2Q8N158 579 aa23.46■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.46■■□□□ 1.35
AP2S1-204ENST00000597020 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.45■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 CRY2Q49AN0 593 aa23.45■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 PCNTO95613 3336 aa23.44■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 OLFM4Q6UX06 510 aa23.44■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 AIDAQ96BJ3 306 aa23.44■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.43■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms