RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-226	ENST00000593200	SRGN	P10124	158 aa		13.79	□□□□□ -0.2
EFTUD2-226	ENST00000593200	ST5	P78524	1137 aa		13.79	□□□□□ -0.2
EFTUD2-226	ENST00000593200	ERFE	Q4G0M1	354 aa		13.79	□□□□□ -0.2
EFTUD2-226	ENST00000593200	STYK1	Q6J9G0	422 aa		13.79	□□□□□ -0.2
EFTUD2-226	ENST00000593200	CNKSR1	Q969H4	720 aa		13.79	□□□□□ -0.2
EFTUD2-226	ENST00000593200	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		13.79	□□□□□ -0.2
EFTUD2-226	ENST00000593200	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
EFTUD2-226	ENST00000593200	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.79	□□□□□ -0.2
EFTUD2-226	ENST00000593200	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EFTUD2-226	ENST00000593200	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
EFTUD2-226	ENST00000593200	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
EFTUD2-226	ENST00000593200	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	MCM10	Q7L590	875 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	MASTL	Q96GX5	879 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	PPP2R1A	P30153	589 aa		13.76	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	SOGA3	Q5TF21	947 aa		13.76	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		13.76	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	RGL2	O15211	777 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	NBPF26	B4DH59	902 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	DCTN1	Q14203	1278 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	NBPF15	Q8N660	670 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	NPR1	P16066	1061 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	SCN4A	P35499	1836 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	CCDC93	Q567U6	631 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	POTEI	P0CG38	1075 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	POTEJ	P0CG39	1038 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-226	ENST00000593200	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	HLF	Q16534	295 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	CREBZF	Q9NS37	354 aa		13.7	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	NUP98	P52948	1817 aa		13.69	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	FAM177B	A6PVY3	158 aa		13.69	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	TNS4	Q8IZW8	715 aa		13.69	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		13.69	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	ALDH1B1	P30837	517 aa		13.68	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	OLFM4	Q6UX06	510 aa		13.68	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	LDHD	Q86WU2	507 aa		13.68	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		13.68	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		13.67	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	SNED1	Q8TER0	1413 aa		13.67	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.67	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	NEFM	P07197	916 aa		13.67	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		13.67	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	ABCC12	Q96J65	1359 aa		13.67	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	PASK	Q96RG2	1323 aa		13.66	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	CRY2	Q49AN0	593 aa		13.66	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		13.66	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	NYX	Q9GZU5	481 aa		13.66	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		13.65	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.65	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	NGEF	Q8N5V2	710 aa		13.65	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	CNTNAP1	P78357	1384 aa		13.65	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
EFTUD2-226	ENST00000593200	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	FZD9	O00144	591 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	SYNE4	Q8N205	404 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	PSMD1	Q99460	953 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	HACL1	Q9UJ83	578 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		13.64	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	CAPN15	O75808	1086 aa		13.63	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	EPHX2	P34913	555 aa		13.63	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	NFE2L2	Q16236	605 aa		13.63	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		13.63	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		13.63	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		13.62	□□□□□ -0.23
EFTUD2-226	ENST00000593200	MYL6B	P14649	208 aa		13.62	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms