RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589232.5

GTF3C2-AS1-206, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 254 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PRDM10Q9NQV6 1147 aa5.75□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa5.75□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SCN4AP35499 1836 aa5.75□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MAP3K19Q56UN5 1328 aa5.74□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KDM2BQ8NHM5 1336 aa5.74□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 THSD7BQ9C0I4 1608 aa5.74□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SSFA2P28290 1259 aa5.74□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HOXC9P31274 260 aa5.74□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 VEGFBP49765 207 aa5.74□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RGS19P49795 217 aa5.74□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ASAP1Q9ULH1 1129 aa5.74□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa5.74□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CNTNAP1P78357 1384 aa5.73□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa5.73□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GLTPD2A6NH11 291 aa5.73□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CCDC85CA6NKD9 419 aa5.73□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GYS1P13807 737 aa5.73□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SIK1P57059 783 aa5.73□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DDR1Q08345 913 aa5.73□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa5.73□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EVC2Q86UK5 1308 aa5.73□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SCN11AQ9UI33 1791 aa5.72□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PLCB2Q00722 1185 aa5.72□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 WBP1LQ9NX94 342 aa5.72□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PIM2Q9P1W9 311 aa5.72□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TSKSQ9UJT2 592 aa5.72□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa5.71□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 A0A1W2PP64 1363 aa5.71□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KDRP35968 1356 aa5.71□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NFKBIEO00221 500 aa5.71□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ARHGAP33O14559 1287 aa5.71□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HRO43593 1189 aa5.71□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ATP6V1AP38606 617 aa5.71□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMF1P82094 1093 aa5.71□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CCDC87Q9NVE4 849 aa5.71□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TK2O00142 265 aa5.7□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FKBP8Q14318 412 aa5.7□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMEM92Q6UXU6 159 aa5.7□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ATG3Q9NT62 314 aa5.7□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PASKQ96RG2 1323 aa5.7□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CARMIL3Q8ND23 1372 aa5.69□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DDNO94850 711 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TATP17735 454 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 AMPHP49418 695 aa5.69□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PSEN1P49768 467 aa5.69□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TRAPPC3LQ5T215 181 aa5.69□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NLGN1Q8N2Q7 840 aa5.69□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMC1Q8TDI8 760 aa5.69□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PARP3Q9Y6F1 533 aa5.69□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 AKAP11Q9UKA4 1901 aa5.69□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa5.69□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa5.69□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NUDT7P0C024 238 aa5.68□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LMNB1P20700 586 aa5.68□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa5.68□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa5.68□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 AIDAQ96BJ3 306 aa5.68□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CFAP44Q96MT7 982 aa5.68□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FBXO3Q9UK99 471 aa5.68□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NCAPD2Q15021 1401 aa5.67□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RPS6KA4O75676 772 aa5.67□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TM4SF1P30408 202 aa5.67□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CCDC24Q8N4L8 307 aa5.67□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MCOLN1Q9GZU1 580 aa5.67□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LHX6Q9UPM6 363 aa5.67□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RFC4P35249 363 aa5.66□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 L3MBTL2Q969R5 705 aa5.66□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GGNBP2Q9H3C7 697 aa5.66□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMOD3Q9NYL9 352 aa5.66□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CLSPNQ9HAW4 1339 aa5.66□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RASSF10A6NK89 507 aa5.65□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMEM88BA6NKF7 163 aa5.65□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 AOC2O75106 756 aa5.65□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SOX10P56693 466 aa5.65□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DEFB115Q30KQ5 88 aa5.65□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DMRTA1Q5VZB9 504 aa5.65□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms