RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 SLC4A9Q96Q91 983 aa10.76□□□□□ -0.69
GGA3-218ENST00000584243 MRS2Q9HD23 443 aa10.76□□□□□ -0.69
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GGA3-218ENST00000584243 KDRP35968 1356 aa10.76□□□□□ -0.69
GGA3-218ENST00000584243 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
GGA3-218ENST00000584243 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
GGA3-218ENST00000584243 C2CD5Q86YS7 1000 aa10.75□□□□□ -0.69
GGA3-218ENST00000584243 CABP2Q9NPB3 220 aa10.75□□□□□ -0.69
GGA3-218ENST00000584243 RGPD2P0DJD1 1756 aa10.75□□□□□ -0.69
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GGA3-218ENST00000584243 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa10.74□□□□□ -0.69
GGA3-218ENST00000584243 ASAP1Q9ULH1 1129 aa10.74□□□□□ -0.69
GGA3-218ENST00000584243 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
GGA3-218ENST00000584243 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
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GGA3-218ENST00000584243 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
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GGA3-218ENST00000584243 EPS15P42566 896 aa10.7□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
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GGA3-218ENST00000584243 HDAC9Q9UKV0 1011 aa10.7□□□□□ -0.7
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GGA3-218ENST00000584243 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 CACNA1SQ13698 1873 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 SLX4Q8IY92 1834 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 MON2Q7Z3U7 1717 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 H0YIN7 160 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 HUNKP57058 714 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 GPC2Q8N158 579 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 DEFB123Q8N688 67 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 TMC1Q8TDI8 760 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 ATG3Q9NT62 314 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 MTMR10Q9NXD2 777 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 BCORQ6W2J9 1755 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 ZNF831Q5JPB2 1677 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 IP6K1Q92551 441 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 ZNF408Q9H9D4 720 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 COL4A5P29400 1685 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 MAP3K19Q56UN5 1328 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa10.66□□□□□ -0.7
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GGA3-218ENST00000584243 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
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GGA3-218ENST00000584243 DLK2Q6UY11 383 aa10.66□□□□□ -0.7
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GGA3-218ENST00000584243 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 TBC1D8O95759 1140 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 USHBP1Q8N6Y0 703 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-218ENST00000584243 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.74e-6■□□□□ 8.2
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GGA3-218ENST00000584243 BDP1A6H8Y1 2624 aa10.65□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 CGNL1Q0VF96 1302 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 MAP3K12Q12852 859 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 NBPF6Q5VWK0 638 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 NGEFQ8N5V2 710 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 C7orf43Q8WVR3 580 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 NBPF4Q96M43 638 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 PKD1L2Q7Z442 2459 aa10.63□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 SERPINB2P05120 415 aa10.63□□□□□ -0.71
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GGA3-218ENST00000584243 A0A1W2PPC1 479 aa10.62□□□□□ -0.71
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GGA3-218ENST00000584243 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
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GGA3-218ENST00000584243 GPR153Q6NV75 609 aa10.62□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 NME9Q86XW9 330 aa10.62□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 FAM9BQ8IZU0 186 aa10.62□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 TMEM265A0A087WTH1 108 aa10.61□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.61□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 CCDC102AQ96A19 550 aa10.61□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 ARMC5Q96C12 935 aa10.61□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa10.61□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 BCL2L12Q9HB09 334 aa10.61□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 PGAP2Q9UHJ9 254 aa10.61□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa10.61□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 OLFM4Q6UX06 510 aa10.6□□□□□ -0.71
GGA3-218ENST00000584243 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.6□□□□□ -0.71
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