RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GPS1-223	ENST00000584229	CAMTA2	O94983	1202 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-223	ENST00000584229	MMP10	P09238	476 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-223	ENST00000584229	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-223	ENST00000584229	KLHL34	Q8N239	644 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-223	ENST00000584229	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-223	ENST00000584229	HYPK	Q9NX55	129 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-223	ENST00000584229	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-223	ENST00000584229	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
GPS1-223	ENST00000584229	VAMP4	O75379	141 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GPS1-223	ENST00000584229	COPS6	Q7L5N1	327 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GPS1-223	ENST00000584229	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GPS1-223	ENST00000584229	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		32.03	■■■□□ 2.72
GPS1-223	ENST00000584229	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		32.03	■■■□□ 2.72
GPS1-223	ENST00000584229	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		32.02	■■■□□ 2.72
GPS1-223	ENST00000584229	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		32.02	■■■□□ 2.72
GPS1-223	ENST00000584229	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		32	■■■□□ 2.71
GPS1-223	ENST00000584229	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
GPS1-223	ENST00000584229	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
GPS1-223	ENST00000584229	NFIX	Q14938	502 aa		31.99	■■■□□ 2.71
GPS1-223	ENST00000584229	HLF	Q16534	295 aa		31.99	■■■□□ 2.71
GPS1-223	ENST00000584229	SLC4A2	P04920	1241 aa		31.98	■■■□□ 2.71
GPS1-223	ENST00000584229	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		31.97	■■■□□ 2.71
GPS1-223	ENST00000584229	DDR1	Q08345	913 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GPS1-223	ENST00000584229	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GPS1-223	ENST00000584229	SETDB2	Q96T68	719 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GPS1-223	ENST00000584229	NPHP1	O15259	732 aa		31.95	■■■□□ 2.71
GPS1-223	ENST00000584229	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	31.95	■■■□□ 2.71
GPS1-223	ENST00000584229	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		31.94	■■■□□ 2.7
GPS1-223	ENST00000584229	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-223	ENST00000584229	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-223	ENST00000584229	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-223	ENST00000584229	TM4SF1	P30408	202 aa		31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-223	ENST00000584229	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-223	ENST00000584229	FAM177B	A6PVY3	158 aa		31.92	■■■□□ 2.7
GPS1-223	ENST00000584229	GPT	P24298	496 aa		31.92	■■■□□ 2.7
GPS1-223	ENST00000584229	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
GPS1-223	ENST00000584229	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		31.92	■■■□□ 2.7
GPS1-223	ENST00000584229	G2E3	Q7L622	706 aa		31.91	■■■□□ 2.7
GPS1-223	ENST00000584229	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		31.91	■■■□□ 2.7
GPS1-223	ENST00000584229	RGL2	O15211	777 aa		31.9	■■■□□ 2.7
GPS1-223	ENST00000584229	SERPINB2	P05120	415 aa		31.9	■■■□□ 2.7
GPS1-223	ENST00000584229	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		31.9	■■■□□ 2.7
GPS1-223	ENST00000584229	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
GPS1-223	ENST00000584229	ATP10D	Q9P241	1426 aa		31.9	■■■□□ 2.7
GPS1-223	ENST00000584229	FLII	Q13045	1269 aa		31.89	■■■□□ 2.7
GPS1-223	ENST00000584229	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
GPS1-223	ENST00000584229	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
GPS1-223	ENST00000584229	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		31.88	■■■□□ 2.69
GPS1-223	ENST00000584229	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
GPS1-223	ENST00000584229	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
GPS1-223	ENST00000584229	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		31.87	■■■□□ 2.69
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF428	Q96B54	188 aa		31.86	■■■□□ 2.69
GPS1-223	ENST00000584229	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		31.85	■■■□□ 2.69
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		31.84	■■■□□ 2.69
GPS1-223	ENST00000584229	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		31.84	■■■□□ 2.69
GPS1-223	ENST00000584229	CNBD1	Q8NA66	436 aa		31.84	■■■□□ 2.69
GPS1-223	ENST00000584229	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		31.84	■■■□□ 2.69
GPS1-223	ENST00000584229	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		31.83	■■■□□ 2.69
GPS1-223	ENST00000584229	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		31.83	■■■□□ 2.69
GPS1-223	ENST00000584229	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
GPS1-223	ENST00000584229	TCIRG1	Q13488	830 aa		31.83	■■■□□ 2.69
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		31.83	■■■□□ 2.69
GPS1-223	ENST00000584229	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		31.83	■■■□□ 2.69
GPS1-223	ENST00000584229	MYD88	Q99836	296 aa		31.83	■■■□□ 2.69
GPS1-223	ENST00000584229	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		31.82	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	KSR2	Q6VAB6	950 aa		31.82	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		31.82	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	ADCY9	O60503	1353 aa		31.81	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		31.81	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	ST5	P78524	1137 aa		31.81	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	PARP10	Q53GL7	1025 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	SYT17	Q9BSW7	474 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	NYX	Q9GZU5	481 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		31.79	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		31.79	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	SUSD4	Q5VX71	490 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	CACNA1S	Q13698	1873 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
GPS1-223	ENST00000584229	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	NLRP10	Q86W26	655 aa		31.76	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		31.76	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229		F6X3S4	739 aa		31.75	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		31.75	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		31.74	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		31.73	■■■□□ 2.67
GPS1-223	ENST00000584229	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67

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