RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583983.1

GPS1-222, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 5

Gene GPS1, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-222	ENST00000583983	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983	HLF	Q16534	295 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983	SETDB2	Q96T68	719 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	28.5	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		28.49	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	28.49	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983	GPR162	Q16538	588 aa		28.49	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		28.48	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		28.47	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983		A0A0G2JLW4	131 aa		28.46	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		28.46	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	28.46	■■■□□ 2.15
GPS1-222	ENST00000583983	DPEP1	P16444	411 aa		28.45	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	28.45	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	COPS6	Q7L5N1	327 aa		28.45	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	TSPYL6	Q8N831	410 aa		28.45	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		28.45	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	28.45	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	ZNF521	Q96K83	1311 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	28.43	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	28.42	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		28.42	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	KCNA3	P22001	575 aa		28.41	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	CNBD1	Q8NA66	436 aa		28.41	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	HYPK	Q9NX55	129 aa		28.41	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	ATP10D	Q9P241	1426 aa		28.41	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		28.4	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	NUP98	P52948	1817 aa		28.4	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	CHRNA5	P30532	468 aa		28.39	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		28.39	■■■□□ 2.14
GPS1-222	ENST00000583983	GOLGA2	Q08379	1002 aa		28.38	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	28.38	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		28.38	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		28.38	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		28.38	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	UTRN	P46939	3433 aa		28.37	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	NPHP1	O15259	732 aa		28.37	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	GRIN3B	O60391	1043 aa		28.37	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		28.37	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	FAM177B	A6PVY3	158 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	GPT	P24298	496 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	ST5	P78524	1137 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	PIM2	Q9P1W9	311 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	PDE6B	P35913	854 aa		28.33	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		28.33	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	BCS1L	Q9Y276	419 aa		28.33	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
GPS1-222	ENST00000583983		H0YIN7	160 aa		28.32	■■■□□ 2.12
GPS1-222	ENST00000583983	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		28.32	■■■□□ 2.12
GPS1-222	ENST00000583983	NYX	Q9GZU5	481 aa		28.32	■■■□□ 2.12
GPS1-222	ENST00000583983	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		28.32	■■■□□ 2.12
GPS1-222	ENST00000583983	VAMP4	O75379	141 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GPS1-222	ENST00000583983	TCIRG1	Q13488	830 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GPS1-222	ENST00000583983	PARP10	Q53GL7	1025 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GPS1-222	ENST00000583983	SUSD4	Q5VX71	490 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GPS1-222	ENST00000583983	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
GPS1-222	ENST00000583983	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
GPS1-222	ENST00000583983	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
GPS1-222	ENST00000583983	STK31	Q9BXU1	1019 aa		28.3	■■■□□ 2.12
GPS1-222	ENST00000583983	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
GPS1-222	ENST00000583983	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GPS1-222	ENST00000583983	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GPS1-222	ENST00000583983		E9PSI1	815 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GPS1-222	ENST00000583983	NTSR2	O95665	410 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GPS1-222	ENST00000583983	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GPS1-222	ENST00000583983	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	ERFE	Q4G0M1	354 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	NLRP10	Q86W26	655 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	ABCC12	Q96J65	1359 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	SLC4A2	P04920	1241 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	SRGN	P10124	158 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	SLFN5	Q08AF3	891 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	28.25	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	YY1	P25490	414 aa		28.24	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	TTLL6	Q8N841	843 aa		28.24	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	28.24	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		28.24	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
GPS1-222	ENST00000583983	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		28.23	■■■□□ 2.11

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