RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 DIP2BQ9P265 1576 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 SERTM1A2A2V5 107 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 E9PSI1 815 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 H3BRB1 525 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 AVPP01185 164 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 NOS2P35228 1153 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 MTMR3Q13615 1198 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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PTPRM-208ENST00000578600 KIF13AQ9H1H9 1805 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 COX20Q5RI15 118 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 C16orf46Q6P387 395 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 MYO19Q96H55 970 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 ADGRL1O94910 1474 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 TNFRSF10BO14763 440 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 ERCC3P19447 782 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 ARHGAP4P98171 946 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 CABP1Q9NZU7 370 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
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PTPRM-208ENST00000578600 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-208ENST00000578600 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 ABCC2Q92887 1545 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 FAM187AA6NFU0 413 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 FAM13AO94988 1023 aa8.7□□□□□ -1.02
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PTPRM-208ENST00000578600 C4orf17Q53FE4 359 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 GLI2P10070 1586 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 TOP2BQ02880 1626 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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PTPRM-208ENST00000578600 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPRM-208ENST00000578600 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPRM-208ENST00000578600 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPRM-208ENST00000578600 DGAT1O75907 488 aa8.68□□□□□ -1.02
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PTPRM-208ENST00000578600 MPSTP25325 297 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 RTN1Q16799 776 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 FAM26DQ5JW98 314 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 ASXL2Q76L83 1435 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 TXLNAP40222 546 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 ADCY10Q96PN6 1610 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 HECW2Q9P2P5 1572 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 KIF27Q86VH2 1401 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 PLA2G4AP47712 749 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 WDR44Q5JSH3 913 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
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PTPRM-208ENST00000578600 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 UACAQ9BZF9 1416 aa8.65□□□□□ -1.02
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PTPRM-208ENST00000578600 ZBTB39O15060 712 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 BMP1P13497 986 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 POU4F2Q12837 409 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRM-208ENST00000578600 IGF1RP08069 1367 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 TTLL8A6PVC2 850 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 FZD6O60353 706 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 GFRA3O60609 400 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 MAPK1P28482 360 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 PHKA2P46019 1235 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 DGKZQ13574 1117 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.64□□□□□ -1.03
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