RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576069.5

SPNS3-206, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS3, Length 834 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-206ENST00000576069 SETDB2Q96T68 719 aa25.05■■□□□ 1.6
SPNS3-206ENST00000576069 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SPNS3-206ENST00000576069 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.05■■□□□ 1.6
SPNS3-206ENST00000576069 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.05■■□□□ 1.6
SPNS3-206ENST00000576069 SCN7AQ01118 1682 aa25.04■■□□□ 1.6
SPNS3-206ENST00000576069 ANXA1P04083 346 aa25.04■■□□□ 1.6
SPNS3-206ENST00000576069 SERPINB2P05120 415 aa25.04■■□□□ 1.6
SPNS3-206ENST00000576069 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.04■■□□□ 1.6
SPNS3-206ENST00000576069 HYPKQ9NX55 129 aa25.04■■□□□ 1.6
SPNS3-206ENST00000576069 HLFQ16534 295 aa25.03■■□□□ 1.6
SPNS3-206ENST00000576069 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.03■■□□□ 1.6
SPNS3-206ENST00000576069 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.03■■□□□ 1.6
SPNS3-206ENST00000576069 TGFB2P61812 414 aa25.02■■□□□ 1.6
SPNS3-206ENST00000576069 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SPNS3-206ENST00000576069 COPS6Q7L5N1 327 aa25.02■■□□□ 1.6
SPNS3-206ENST00000576069 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS3-206ENST00000576069 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS3-206ENST00000576069 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS3-206ENST00000576069 BCORQ6W2J9 1755 aa25■■□□□ 1.59
SPNS3-206ENST00000576069 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25■■□□□ 1.59
SPNS3-206ENST00000576069 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SPNS3-206ENST00000576069 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SPNS3-206ENST00000576069 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SPNS3-206ENST00000576069 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.99■■□□□ 1.59
SPNS3-206ENST00000576069 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
SPNS3-206ENST00000576069 E9PSI1 815 aa24.98■■□□□ 1.59
SPNS3-206ENST00000576069 VAMP4O75379 141 aa24.97■■□□□ 1.59
SPNS3-206ENST00000576069 ATP10DQ9P241 1426 aa24.95■■□□□ 1.59
SPNS3-206ENST00000576069 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.95■■□□□ 1.59
SPNS3-206ENST00000576069 SLFN5Q08AF3 891 aa24.95■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.95■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.95■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 STK31Q9BXU1 1019 aa24.95■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 CNBD1Q8NA66 436 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.93■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 A0A0G2JLW4 131 aa24.92■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.91■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 NPHP1O15259 732 aa24.91■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 DPEP1P16444 411 aa24.91■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 ST5P78524 1137 aa24.91■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 TCIRG1Q13488 830 aa24.91■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 GPR162Q16538 588 aa24.91■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 NYXQ9GZU5 481 aa24.91■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.91■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 SLC4A2P04920 1241 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 KCNA3P22001 575 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 GPTP24298 496 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 PARP10Q53GL7 1025 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 NUP98P52948 1817 aa24.89■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 PDE6BP35913 854 aa24.89■■□□□ 1.58
SPNS3-206ENST00000576069 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.88■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.88■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.88■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 FAM177BA6PVY3 158 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 SUSD4Q5VX71 490 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 H0YIN7 160 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 CHRNA5P30532 468 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 PIM2Q9P1W9 311 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 GRIN3BO60391 1043 aa24.85■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.85■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 NLRP10Q86W26 655 aa24.84■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.84■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.84■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 UTRNP46939 3433 aa24.83■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 NTSR2O95665 410 aa24.83■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 KSR2Q6VAB6 950 aa24.83■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 G2E3Q7L622 706 aa24.83■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 ZNF428Q96B54 188 aa24.83■■□□□ 1.57
SPNS3-206ENST00000576069 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.83■■□□□ 1.56
SPNS3-206ENST00000576069 FLIIQ13045 1269 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS3-206ENST00000576069 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SPNS3-206ENST00000576069 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SPNS3-206ENST00000576069 ERFEQ4G0M1 354 aa24.81■■□□□ 1.56
SPNS3-206ENST00000576069 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SPNS3-206ENST00000576069 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.81■■□□□ 1.56
SPNS3-206ENST00000576069 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SPNS3-206ENST00000576069 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.8■■□□□ 1.56
SPNS3-206ENST00000576069 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms