RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574157.5

NOMO3-211, Transcript of NODAL modulator 3, human

TSL 3

Gene NOMO3, Length 821 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOMO3-211	ENST00000574157	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NOMO3-211	ENST00000574157	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NOMO3-211	ENST00000574157	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NOMO3-211	ENST00000574157	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NOMO3-211	ENST00000574157	USP16	Q9Y5T5	823 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NOMO3-211	ENST00000574157	ADCY9	O60503	1353 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NOMO3-211	ENST00000574157	STARD3NL	O95772	234 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NOMO3-211	ENST00000574157	GPR162	Q16538	588 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NOMO3-211	ENST00000574157	PROSER3	Q2NL68	480 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NOMO3-211	ENST00000574157	SYT17	Q9BSW7	474 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NOMO3-211	ENST00000574157	CASZ1	Q86V15	1759 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	SIK1	P57059	783 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	NECTIN2	Q92692	538 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	MTFR1L	Q9H019	292 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	COG6	Q9Y2V7	657 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	PTGER2	P43116	358 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	PROM2	Q8N271	834 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	NBPF15	Q8N660	670 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	ARX	Q96QS3	562 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	SCN7A	Q01118	1682 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	ANXA1	P04083	346 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	C1QTNF8	P60827	252 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	ITPK1	Q13572	414 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	C4B	P0C0L5	1744 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	CHD4	Q14839	1912 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157		F6X3S4	739 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	RGL2	O15211	777 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	ALDH1L1	O75891	902 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	A1BG	P04217	495 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	POLD1	P28340	1107 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	MYL6B	P14649	208 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	ATP6V1A	P38606	617 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	COPS6	Q7L5N1	327 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
NOMO3-211	ENST00000574157	COL15A1	P39059	1388 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	LINS1	Q8NG48	757 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	AKT1S1	Q96B36	256 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	UTY	O14607	1347 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	GNAI3	P08754	354 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	MEIS3	Q99687	375 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	C4A	P0C0L4	1744 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	IGKV5-2	P06315	115 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
NOMO3-211	ENST00000574157	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6

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