RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567114.5

RPUSD1-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, human

TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RPUSD1-208	ENST00000567114	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RPUSD1-208	ENST00000567114	GNPAT	O15228	680 aa		32.37	■■■□□ 2.77
RPUSD1-208	ENST00000567114	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		32.37	■■■□□ 2.77
RPUSD1-208	ENST00000567114	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
RPUSD1-208	ENST00000567114	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
RPUSD1-208	ENST00000567114	AK7	Q96M32	723 aa		32.36	■■■□□ 2.77
RPUSD1-208	ENST00000567114	RREB1	Q92766	1687 aa		32.35	■■■□□ 2.77
RPUSD1-208	ENST00000567114	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
RPUSD1-208	ENST00000567114	RPS6KA4	O75676	772 aa		32.35	■■■□□ 2.77
RPUSD1-208	ENST00000567114	BEND3	Q5T5X7	828 aa		32.35	■■■□□ 2.77
RPUSD1-208	ENST00000567114	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
RPUSD1-208	ENST00000567114	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		32.35	■■■□□ 2.77
RPUSD1-208	ENST00000567114	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		32.34	■■■□□ 2.77
RPUSD1-208	ENST00000567114	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
RPUSD1-208	ENST00000567114	C4B	P0C0L5	1744 aa		32.33	■■■□□ 2.77
RPUSD1-208	ENST00000567114	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		32.33	■■■□□ 2.77
RPUSD1-208	ENST00000567114	COL15A1	P39059	1388 aa		32.33	■■■□□ 2.77
RPUSD1-208	ENST00000567114	MYD88	Q99836	296 aa		32.33	■■■□□ 2.77
RPUSD1-208	ENST00000567114	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		32.32	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	BAG6	P46379	1132 aa		32.32	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	SMIM5	Q71RC9	77 aa		32.32	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		32.32	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114		A0A087WZG4	1122 aa		32.3	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	LINS1	Q8NG48	757 aa		32.3	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	ATP10D	Q9P241	1426 aa		32.29	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	CCDC125	Q86Z20	511 aa		32.29	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		32.28	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		32.28	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		32.28	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	HLF	Q16534	295 aa		32.28	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		32.27	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	PHF14	O94880	888 aa		32.27	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	IGKV5-2	P06315	115 aa		32.27	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		32.27	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		32.27	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		32.27	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	ALDH1L1	O75891	902 aa		32.26	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.76
RPUSD1-208	ENST00000567114	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		32.26	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	TCIRG1	Q13488	830 aa		32.25	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	AAMP	Q13685	434 aa		32.25	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	MEIS3	Q99687	375 aa		32.25	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		32.25	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		32.24	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	CAMTA2	O94983	1202 aa		32.24	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		32.24	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	USP44	Q9H0E7	712 aa		32.23	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		32.23	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	RFC4	P35249	363 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZPR1	O75312	459 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	ADRA2B	P18089	450 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZNF827	Q17R98	1081 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	AKT1S1	Q96B36	256 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	GCKR	Q14397	625 aa		32.2	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	NARF	Q9UHQ1	456 aa		32.2	■■■□□ 2.75
RPUSD1-208	ENST00000567114	GNAI3	P08754	354 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	SSFA2	P28290	1259 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	GPT	P24298	496 aa		32.17	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		32.17	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		32.17	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		32.17	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		32.17	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	GRM8	O00222	908 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	NUP98	P52948	1817 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		32.15	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	GNAI2	P04899	355 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RPUSD1-208	ENST00000567114	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	32.14	■■■□□ 2.74	3e-10	■■■■■ 32.1
RPUSD1-208	ENST00000567114	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
RPUSD1-208	ENST00000567114	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
RPUSD1-208	ENST00000567114	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		32.12	■■■□□ 2.73
RPUSD1-208	ENST00000567114	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
RPUSD1-208	ENST00000567114	NLRP10	Q86W26	655 aa		32.12	■■■□□ 2.73
RPUSD1-208	ENST00000567114	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
RPUSD1-208	ENST00000567114	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	32.12	■■■□□ 2.73
RPUSD1-208	ENST00000567114	RGL2	O15211	777 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RPUSD1-208	ENST00000567114	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
RPUSD1-208	ENST00000567114	STK32B	Q9NY57	414 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RPUSD1-208	ENST00000567114	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73

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