RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564566.1

USP10-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-211ENST00000564566 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
USP10-211ENST00000564566 PCNTO95613 3336 aa22.79■■□□□ 1.24
USP10-211ENST00000564566 PRKAR2BP31323 418 aa22.78■■□□□ 1.24
USP10-211ENST00000564566 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.77■■□□□ 1.24
USP10-211ENST00000564566 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
USP10-211ENST00000564566 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.76■■□□□ 1.23
USP10-211ENST00000564566 CNKSR1Q969H4 720 aa22.76■■□□□ 1.23
USP10-211ENST00000564566 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.76■■□□□ 1.23
USP10-211ENST00000564566 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
USP10-211ENST00000564566 STYK1Q6J9G0 422 aa22.75■■□□□ 1.23
USP10-211ENST00000564566 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.75■■□□□ 1.23
USP10-211ENST00000564566 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.74■■□□□ 1.23
USP10-211ENST00000564566 SRGNP10124 158 aa22.74■■□□□ 1.23
USP10-211ENST00000564566 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
USP10-211ENST00000564566 MASTLQ96GX5 879 aa22.74■■□□□ 1.23
USP10-211ENST00000564566 USP16Q9Y5T5 823 aa22.74■■□□□ 1.23
USP10-211ENST00000564566 CFAP53Q96M91 514 aa22.73■■□□□ 1.23
USP10-211ENST00000564566 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.73■■□□□ 1.23
USP10-211ENST00000564566 POTEIP0CG38 1075 aa22.72■■□□□ 1.23
USP10-211ENST00000564566 POTEJP0CG39 1038 aa22.72■■□□□ 1.23
USP10-211ENST00000564566 SOGA3Q5TF21 947 aa22.72■■□□□ 1.23
USP10-211ENST00000564566 CHADLQ6NUI6 762 aa22.72■■□□□ 1.23
USP10-211ENST00000564566 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
USP10-211ENST00000564566 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.71■■□□□ 1.23
USP10-211ENST00000564566 MCM10Q7L590 875 aa22.7■■□□□ 1.22
USP10-211ENST00000564566 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
USP10-211ENST00000564566 FAM177BA6PVY3 158 aa22.69■■□□□ 1.22
USP10-211ENST00000564566 CCDC93Q567U6 631 aa22.68■■□□□ 1.22
USP10-211ENST00000564566 CREBZFQ9NS37 354 aa22.68■■□□□ 1.22
USP10-211ENST00000564566 NUDCQ9Y266 331 aa22.68■■□□□ 1.22
USP10-211ENST00000564566 SCN4AP35499 1836 aa22.67■■□□□ 1.22
USP10-211ENST00000564566 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
USP10-211ENST00000564566 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
USP10-211ENST00000564566 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
USP10-211ENST00000564566 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.66■■□□□ 1.22
USP10-211ENST00000564566 NPR1P16066 1061 aa22.66■■□□□ 1.22
USP10-211ENST00000564566 DCTN1Q14203 1278 aa22.66■■□□□ 1.22
USP10-211ENST00000564566 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.66■■□□□ 1.22
USP10-211ENST00000564566 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
USP10-211ENST00000564566 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.66■■□□□ 1.22
USP10-211ENST00000564566 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
USP10-211ENST00000564566 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 OLFM4Q6UX06 510 aa22.64■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.63■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 NBPF26B4DH59 902 aa22.63■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.63■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 LDHDQ86WU2 507 aa22.63■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 NBPF15Q8N660 670 aa22.63■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.63■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 CNTNAP1P78357 1384 aa22.61■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 PPP2R1AP30153 589 aa22.6■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 HLFQ16534 295 aa22.6■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.6■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 PASKQ96RG2 1323 aa22.59■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 NGEFQ8N5V2 710 aa22.59■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.59■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 HACL1Q9UJ83 578 aa22.59■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.58■■□□□ 1.21
USP10-211ENST00000564566 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.57■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.57■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.56■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.56■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 ABCC12Q96J65 1359 aa22.56■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.56■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 FOXN1O15353 648 aa22.56■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 ALDH1B1P30837 517 aa22.56■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 EPHX2P34913 555 aa22.56■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 NUP98P52948 1817 aa22.56■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 RGL2O15211 777 aa22.55■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.55■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 SYNE4Q8N205 404 aa22.55■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 AIDAQ96BJ3 306 aa22.54■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 VEGFBP49765 207 aa22.53■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 NEFMP07197 916 aa22.52■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.52■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 JDP2Q8WYK2 163 aa22.52■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 NYXQ9GZU5 481 aa22.52■■□□□ 1.2
USP10-211ENST00000564566 FZD9O00144 591 aa22.51■■□□□ 1.19
USP10-211ENST00000564566 MYL6BP14649 208 aa22.51■■□□□ 1.19
USP10-211ENST00000564566 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
USP10-211ENST00000564566 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
USP10-211ENST00000564566 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
USP10-211ENST00000564566 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.51■■□□□ 1.19
USP10-211ENST00000564566 COL4A5P29400 1685 aa22.5■■□□□ 1.19
USP10-211ENST00000564566 GPTP24298 496 aa22.5■■□□□ 1.19
USP10-211ENST00000564566 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.5■■□□□ 1.19
USP10-211ENST00000564566 GPC2Q8N158 579 aa22.5■■□□□ 1.19
USP10-211ENST00000564566 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.5■■□□□ 1.19
USP10-211ENST00000564566 SNED1Q8TER0 1413 aa22.49■■□□□ 1.19
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