RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563645.1

GDE1-202, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GDE1, Length 769 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-202ENST00000563645 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
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GDE1-202ENST00000563645 ARHGEF15O94989 841 aa7.62□□□□□ -1.19
GDE1-202ENST00000563645 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
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GDE1-202ENST00000563645 TNP2Q05952 138 aa7.62□□□□□ -1.19
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GDE1-202ENST00000563645 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.56□□□□□ -1.2
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GDE1-202ENST00000563645 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GDE1-202ENST00000563645 IER5Q5VY09 327 aa7.54□□□□□ -1.2
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GDE1-202ENST00000563645 KCNQ4P56696 695 aa7.53□□□□□ -1.2
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GDE1-202ENST00000563645 GALNT6Q8NCL4 622 aa7.53□□□□□ -1.2
GDE1-202ENST00000563645 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.53□□□□□ -1.2
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GDE1-202ENST00000563645 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
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GDE1-202ENST00000563645 BCS1LQ9Y276 419 aa7.51□□□□□ -1.21
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GDE1-202ENST00000563645 PODNQ7Z5L7 613 aa7.5□□□□□ -1.21
GDE1-202ENST00000563645 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.5□□□□□ -1.21
GDE1-202ENST00000563645 SLC30A3Q99726 388 aa7.5□□□□□ -1.21
GDE1-202ENST00000563645 GSK3AP49840 483 aa7.49□□□□□ -1.21
GDE1-202ENST00000563645 SYT9Q86SS6 491 aa7.49□□□□□ -1.21
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