RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-205ENST00000563559 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.2■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 PHF14O94880 888 aa22.19■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 UTYO14607 1347 aa22.18■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.18■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 SYCE3A1L190 88 aa22.18■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 EVI5LQ96CN4 794 aa22.18■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 GRM8O00222 908 aa22.17■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 HIP1O00291 1037 aa22.17■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 ORAI2Q96SN7 254 aa22.17■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 PROSER3Q2NL68 480 aa22.16■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.16■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.16■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 AK2P54819 239 aa22.16■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 RASEFQ8IZ41 740 aa22.16■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 SPG7Q9UQ90 795 aa22.16■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.16■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.15■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.15■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.15■■□□□ 1.14
RRN3-205ENST00000563559 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.131e-7■■■■■ 27.4
RRN3-205ENST00000563559 VPS53Q5VIR6 699 aa22.14■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 KCNB2Q92953 911 aa22.14■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 RUFY3Q7L099 469 aa22.13■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 AACSQ86V21 672 aa22.13■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 MST1RQ04912 1400 aa22.13■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.13■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.12■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 USP48Q86UV5 1035 aa22.12■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 TSPY26PQ9H489 355 aa22.12■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.12■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.12■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 STX6O43752 255 aa22.11■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.11■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 KLHL34Q8N239 644 aa22.11■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 SUCLG2Q96I99 432 aa22.11■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.11■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 KIF1AQ12756 1690 aa22.11■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 ERBB3P21860 1342 aa22.11■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.1■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 ZNF790Q6PG37 636 aa22.1■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.1■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.1■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.1■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.09■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 SYT1P21579 422 aa22.09■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 PTH1RQ03431 593 aa22.09■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 PDIA6Q15084 440 aa22.09■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.09■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 MCM5P33992 734 aa22.09■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 NECTIN1Q15223 517 aa22.09■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.09■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 KAZALD1Q96I82 304 aa22.09■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 SNRKQ9NRH2 765 aa22.09■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 SASH1O94885 1247 aa22.08■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.08■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
RRN3-205ENST00000563559 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.08■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 F13A1P00488 732 aa22.07■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 PSMA5P28066 241 aa22.06■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 UBE2HP62256 183 aa22.06■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 MAP4K1Q92918 833 aa22.06■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.06■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.06■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 IGKV5-2P06315 115 aa22.06■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 KCNJ4P48050 445 aa22.06■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.06■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.06■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 TCHHQ07283 1943 aa22.06■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.05■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.05■■□□□ 1.12
RRN3-205ENST00000563559 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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