RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562298.1

VPS9D1-AS1-201, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VPS9D1-AS1, Length 931 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CACNA1SQ13698 1873 aa22.24■■□□□ 1.15
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VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PCNTO95613 3336 aa22.23■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLX4Q8IY92 1834 aa22.22■■□□□ 1.15
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VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LRP10Q7Z4F1 713 aa22■■□□□ 1.11
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF34Q8IZ26 560 aa22■■□□□ 1.11
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.98■■□□□ 1.11
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VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PDIA6Q15084 440 aa21.98■■□□□ 1.11
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLC51AQ86UW1 340 aa21.97■■□□□ 1.11
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SYNE4Q8N205 404 aa21.97■■□□□ 1.11
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 COL4A5P29400 1685 aa21.97■■□□□ 1.11
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VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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