RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560676.5

AKAP13-222, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene AKAP13, Length 3,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-222	ENST00000560676	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	C14orf37	Q86TY3	774 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	MPND	Q8N594	471 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	GPATCH3	Q96I76	525 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	MTMR6	Q9Y217	621 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	HOXB7	P09629	217 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	CCDC192	P0DO97	292 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	HOXC9	P31274	260 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	NLRP6	P59044	892 aa		10.19	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	PLCB2	Q00722	1185 aa		10.19	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		10.19	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		10.19	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		10.19	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	BEND3	Q5T5X7	828 aa		10.19	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	KCNB2	Q92953	911 aa		10.19	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	KIF3A	Q9Y496	699 aa		10.19	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	LARGE1	O95461	756 aa		10.18	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		10.18	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		10.18	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		10.18	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		10.18	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	DIP2B	Q9P265	1576 aa		10.18	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	CACNA1F	O60840	1977 aa		10.18	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	CPA1	P15085	419 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	LTK	P29376	864 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	KRT85	P78386	507 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	MTX1	Q13505	466 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	EVI5L	Q96CN4	794 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	HIP1	O00291	1037 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	PDC	P20941	246 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	PSMA5	P28066	241 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	PTH1R	Q03431	593 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	EID1	Q9Y6B2	187 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		10.16	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	PDE4C	Q08493	712 aa		10.16	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	NECTIN1	Q15223	517 aa		10.16	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	MAP3K11	Q16584	847 aa		10.16	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		10.16	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	ARID3A	Q99856	593 aa		10.16	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		10.16	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		10.16	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	ELP1	O95163	1332 aa		10.16	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		10.16	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	NWD1	Q149M9	1564 aa		10.16	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	ANKRD1	Q15327	319 aa		10.16	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	ME3	Q16798	604 aa		10.16	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		10.16	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	KCNJ4	P48050	445 aa		10.15	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		10.15	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		10.15	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	AP5Z1	O43299	807 aa		10.15	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		10.15	□□□□□ -0.78
AKAP13-222	ENST00000560676		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	ALDH1L1	O75891	902 aa		10.15	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		10.15	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		10.15	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	FGD1	P98174	961 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	ST3GAL1	Q11201	340 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	RNF20	Q5VTR2	975 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	SPC24	Q8NBT2	197 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	MAP4K1	Q92918	833 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	TBX22	Q9Y458	520 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	PIK3C2A	O00443	1686 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	TYRO3	Q06418	890 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	TTC6	Q86TZ1	520 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	NECAB1	Q8N987	351 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AKAP13-222	ENST00000560676	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		10.14	□□□□□ -0.79

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