RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560243.5

RABGGTA-216, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-216ENST00000560243 PIM2Q9P1W9 311 aa15.23■□□□□ 0.03
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RABGGTA-216ENST00000560243 LRP10Q7Z4F1 713 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGGTA-216ENST00000560243 NUP98P52948 1817 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGGTA-216ENST00000560243 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa15.22■□□□□ 0.03
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RABGGTA-216ENST00000560243 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
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RABGGTA-216ENST00000560243 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.17■□□□□ 0.02
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RABGGTA-216ENST00000560243 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.16■□□□□ 0.02
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RABGGTA-216ENST00000560243 ATP10DQ9P241 1426 aa15.16■□□□□ 0.02
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RABGGTA-216ENST00000560243 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
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RABGGTA-216ENST00000560243 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
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RABGGTA-216ENST00000560243 RASSF7Q02833 373 aa15.12■□□□□ 0.01
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RABGGTA-216ENST00000560243 ZNF428Q96B54 188 aa15.11■□□□□ 0.01
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RABGGTA-216ENST00000560243 NLRP10Q86W26 655 aa15.08■□□□□ 0
RABGGTA-216ENST00000560243 SYNE4Q8N205 404 aa15.08■□□□□ 0
RABGGTA-216ENST00000560243 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.08■□□□□ 0
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RABGGTA-216ENST00000560243 HYPKQ9NX55 129 aa15.08■□□□□ 0
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