RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 PDIA6Q15084 440 aa16.08■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 HLFQ16534 295 aa16.08■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 DUSP27Q5VZP5 1158 aa16.08■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 CNBD1Q8NA66 436 aa16.08■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa16.08■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 KCNA3P22001 575 aa16.07■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 ST5P78524 1137 aa16.07■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa16.07■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRR5LQ6MZQ0 368 aa16.07■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 ANXA1P04083 346 aa16.06■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 PROSER3Q2NL68 480 aa16.06■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 TPTE2Q6XPS3 522 aa16.06■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 C2CD5Q86YS7 1000 aa16.06■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC24Q8N4L8 307 aa16.06■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 BRIP1Q9BX63 1249 aa16.06■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZBTB3Q9H5J0 574 aa16.06■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 H0YIN7 160 aa16.05■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 PDE6BP35913 854 aa16.05■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 COPS6Q7L5N1 327 aa16.05■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 LRP10Q7Z4F1 713 aa16.05■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 CHPF2Q9P2E5 772 aa16.05■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa16.05■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM177BA6PVY3 158 aa16.04■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 XAGE3Q8WTP9 111 aa16.04■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 CHMP4AQ9BY43 222 aa16.04■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 LAMB4A4D0S4 1761 aa16.04■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 SCN7AQ01118 1682 aa16.04■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 IL16Q14005 1332 aa16.03■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa16.03■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 GPTP24298 496 aa16.02■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 WDR63Q8IWG1 891 aa16.02■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 TTLL6Q8N841 843 aa16.02■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 C8orf58Q8NAV2 365 aa16.02■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 NYXQ9GZU5 481 aa16.02■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 HYPKQ9NX55 129 aa16.02■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 KIF13BQ9NQT8 1826 aa16.02■□□□□ 0.16
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCER2I3L3R5 266 aa16■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 PARP10Q53GL7 1025 aa16■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa16■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC30Q5VVM6 783 aa16■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF34Q8IZ26 560 aa16■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 ATP10DQ9P241 1426 aa16■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 SUSD4Q5VX71 490 aa15.99■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa15.99■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 TSPYL6Q8N831 410 aa15.99■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 NRXN2Q9P2S2 1712 aa15.99■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 BCORQ6W2J9 1755 aa15.98■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa15.98■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.98■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 MASTLQ96GX5 879 aa15.98■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 UBN2Q6ZU65 1347 aa15.97■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 SRGNP10124 158 aa15.97■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 GOLGA2Q08379 1002 aa15.97■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 TCIRG1Q13488 830 aa15.97■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 STYK1Q6J9G0 422 aa15.97■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 NUTM1Q86Y26 1132 aa15.97■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 CNKSR1Q969H4 720 aa15.97■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 UTRNP46939 3433 aa15.97■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa15.97■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 ERFEQ4G0M1 354 aa15.96■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 STK31Q9BXU1 1019 aa15.96■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 MYH16Q9H6N6 1097 aa15.96■□□□□ 0.15
USP3-AS1-205ENST00000560067 FANCIQ9NVI1 1328 aa15.95■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 NTSR2O95665 410 aa15.95■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 NPR1P16066 1061 aa15.95■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.95■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 NLRP10Q86W26 655 aa15.94■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 C21orf2O43822 256 aa15.93■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 ABCC12Q96J65 1359 aa15.92■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 ALDH1B1P30837 517 aa15.92■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 C9orf131Q5VYM1 1079 aa15.92■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP3-AS1-205ENST00000560067 NLRP3Q96P20 1036 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms