RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557434.5

LGMN-216, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LGMN, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-216ENST00000557434 APBA3O96018 575 aa21.97■■□□□ 1.11
LGMN-216ENST00000557434 SMIM5Q71RC9 77 aa21.97■■□□□ 1.11
LGMN-216ENST00000557434 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.97■■□□□ 1.11
LGMN-216ENST00000557434 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
LGMN-216ENST00000557434 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
LGMN-216ENST00000557434 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.97■■□□□ 1.11
LGMN-216ENST00000557434 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
LGMN-216ENST00000557434 IGKV5-2P06315 115 aa21.96■■□□□ 1.11
LGMN-216ENST00000557434 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.96■■□□□ 1.11
LGMN-216ENST00000557434 NUP98P52948 1817 aa21.96■■□□□ 1.11
LGMN-216ENST00000557434 TXNRD1Q16881 649 aa21.95■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.95■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 MEIS3Q99687 375 aa21.95■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.95■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.95■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.94■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.94■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 BCORQ6W2J9 1755 aa21.93■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.93■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 COL15A1P39059 1388 aa21.93■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.93■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 HLFQ16534 295 aa21.92■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.92■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 USP44Q9H0E7 712 aa21.92■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.92■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 C4AP0C0L4 1744 aa21.92■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.92■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 MYD88Q99836 296 aa21.92■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 LINS1Q8NG48 757 aa21.91■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.91■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.9■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 RPS6KA4O75676 772 aa21.9■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.9■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 GNPATO15228 680 aa21.89■■□□□ 1.1
LGMN-216ENST00000557434 SCN7AQ01118 1682 aa21.89■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.89■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 CAMTA2O94983 1202 aa21.89■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.89■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 ALDH1L1O75891 902 aa21.88■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 AAMPQ13685 434 aa21.88■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.88■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.87■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 ARXQ96QS3 562 aa21.87■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.87■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 TCIRG1Q13488 830 aa21.86■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 GCKRQ14397 625 aa21.86■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 ZNF827Q17R98 1081 aa21.86■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 IGHDP01880 384 aa21.85■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.85■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.85■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.85■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 UTYO14607 1347 aa21.85■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.84■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 AKT1S1Q96B36 256 aa21.84■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 AK7Q96M32 723 aa21.84■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.84■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
LGMN-216ENST00000557434 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.83■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.83■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 GRM8O00222 908 aa21.82■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 CASP7P55210 303 aa21.82■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 KAZALD1Q96I82 304 aa21.82■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 GNAI3P08754 354 aa21.82■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.82■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 PHF14O94880 888 aa21.81■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 NARFQ9UHQ1 456 aa21.81■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 A0A087WZG4 1122 aa21.8■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 GPTP24298 496 aa21.8■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 CEP85Q6P2H3 762 aa21.8■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.8■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 NLRP10Q86W26 655 aa21.79■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 GNAI2P04899 355 aa21.79■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.79■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 H7C1W4 665 aa21.78■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.78■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 SUCLG2Q96I99 432 aa21.78■■□□□ 1.08
LGMN-216ENST00000557434 SSFA2P28290 1259 aa21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms