RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556240.1

GPHN-212, Transcript of gephyrin, humanhuman

TSL 3

Gene GPHN, Length 404 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHN-212ENST00000556240 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.37□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.37□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 UCN2Q96RP3 112 aa7.37□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.37□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 STRN4Q9NRL3 753 aa7.37□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.36□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 FURINP09958 794 aa7.36□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.36□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 MARK1Q9P0L2 795 aa7.36□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 EFSO43281 561 aa7.35□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 LAMC2Q13753 1193 aa7.35□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 TEAD4Q15561 434 aa7.35□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 TBCELQ5QJ74 424 aa7.35□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 CD163Q86VB7 1156 aa7.35□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 NOS2P35228 1153 aa7.34□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 CHRNA4P43681 627 aa7.34□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 EPHA4P54764 986 aa7.34□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.34□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.34□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 TNS4Q8IZW8 715 aa7.34□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.34□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.34□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.34□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.34□□□□□ -1.23
GPHN-212ENST00000556240 RASA1P20936 1047 aa7.33□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 XP32Q5T750 250 aa7.33□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 CCDC102BQ68D86 513 aa7.33□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 OGFOD1Q8N543 542 aa7.33□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.33□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.33□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 EML1O00423 815 aa7.32□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 SYT9Q86SS6 491 aa7.32□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 TRIM11Q96F44 468 aa7.32□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.32□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 SERTM1A2A2V5 107 aa7.31□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 ALAS2P22557 587 aa7.31□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 RFX1P22670 979 aa7.31□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 ELOA3BQ3SY89 546 aa7.31□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.31□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 ELOA3Q8NG57 546 aa7.31□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.31□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 PLVAPQ9BX97 442 aa7.31□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.3□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 SEC13P55735 322 aa7.29□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 FAM196BA6NMK8 535 aa7.28□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 M0R2N6 131 aa7.28□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 SIN3BO75182 1162 aa7.28□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.28□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 CLDN10P78369 228 aa7.28□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 SIX5Q8N196 739 aa7.28□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.28□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 SLC30A3Q99726 388 aa7.28□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GPHN-212ENST00000556240 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 DOC2BQ14184 412 aa7.27□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.27□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 MDFIQ99750 246 aa7.27□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 ARID3CA6NKF2 412 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 USP17L15C9J2P7 530 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 USP17L10C9JJH3 530 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 USP17L12C9JPN9 530 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 USP17L11C9JVI0 530 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 USP17L21D6R901 530 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 USP17L18D6R9N7 530 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 USP17L22D6RA61 530 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 USP17L19D6RCP7 530 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 USP17L20D6RJB6 530 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 SPEM2Q0P670 501 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 USP17L24Q0WX57 530 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 HINFPQ9BQA5 517 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.26□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 M0R082 166 aa7.25□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 GATA4P43694 442 aa7.25□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 NEUROD1Q13562 356 aa7.25□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.25□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.25□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 Q8N3U1 123 aa7.25□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.25□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.25□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 TNFRSF25Q93038 417 aa7.25□□□□□ -1.25
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