RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552897.5

TPCN1-222, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 4

Gene TPCN1, Length 596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-222	ENST00000552897	SERPINB2	P05120	415 aa		31.34	■■■□□ 2.61
TPCN1-222	ENST00000552897	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		31.34	■■■□□ 2.61
TPCN1-222	ENST00000552897	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		31.33	■■■□□ 2.61
TPCN1-222	ENST00000552897	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		31.32	■■■□□ 2.6
TPCN1-222	ENST00000552897	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		31.32	■■■□□ 2.6
TPCN1-222	ENST00000552897	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		31.31	■■■□□ 2.6
TPCN1-222	ENST00000552897	COPS6	Q7L5N1	327 aa		31.31	■■■□□ 2.6
TPCN1-222	ENST00000552897	RGL2	O15211	777 aa		31.3	■■■□□ 2.6
TPCN1-222	ENST00000552897	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		31.3	■■■□□ 2.6
TPCN1-222	ENST00000552897	SETDB2	Q96T68	719 aa		31.3	■■■□□ 2.6
TPCN1-222	ENST00000552897	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	31.3	■■■□□ 2.6
TPCN1-222	ENST00000552897	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		31.29	■■■□□ 2.6
TPCN1-222	ENST00000552897	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
TPCN1-222	ENST00000552897	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		31.29	■■■□□ 2.6
TPCN1-222	ENST00000552897	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		31.28	■■■□□ 2.6
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		31.27	■■■□□ 2.6
TPCN1-222	ENST00000552897	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	31.27	■■■□□ 2.6
TPCN1-222	ENST00000552897	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		31.27	■■■□□ 2.6
TPCN1-222	ENST00000552897	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		31.27	■■■□□ 2.6
TPCN1-222	ENST00000552897		A0A0G2JLW4	131 aa		31.26	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	GOLGA2	Q08379	1002 aa		31.26	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		31.26	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		31.26	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	DPEP1	P16444	411 aa		31.25	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		31.25	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	31.24	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	TGFB2	P61812	414 aa		31.24	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	31.24	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		31.23	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	31.23	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	HYPK	Q9NX55	129 aa		31.23	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	NUP98	P52948	1817 aa		31.23	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	VAMP4	O75379	141 aa		31.22	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	31.22	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	KCNA3	P22001	575 aa		31.22	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		31.22	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	GPT	P24298	496 aa		31.21	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	CHRNA5	P30532	468 aa		31.21	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		31.21	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		31.21	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	FAM177B	A6PVY3	158 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	GPR162	Q16538	588 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	ATP10D	Q9P241	1426 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TPCN1-222	ENST00000552897	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		31.2	■■■□□ 2.58
TPCN1-222	ENST00000552897	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
TPCN1-222	ENST00000552897	SLFN5	Q08AF3	891 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TPCN1-222	ENST00000552897	CNBD1	Q8NA66	436 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TPCN1-222	ENST00000552897	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
TPCN1-222	ENST00000552897	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		31.17	■■■□□ 2.58
TPCN1-222	ENST00000552897	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TPCN1-222	ENST00000552897	SUSD4	Q5VX71	490 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TPCN1-222	ENST00000552897	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		31.16	■■■□□ 2.58
TPCN1-222	ENST00000552897	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		31.15	■■■□□ 2.58
TPCN1-222	ENST00000552897		E9PSI1	815 aa		31.14	■■■□□ 2.58
TPCN1-222	ENST00000552897	TCIRG1	Q13488	830 aa		31.14	■■■□□ 2.58
TPCN1-222	ENST00000552897	G2E3	Q7L622	706 aa		31.14	■■■□□ 2.58
TPCN1-222	ENST00000552897	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		31.14	■■■□□ 2.58
TPCN1-222	ENST00000552897	UTRN	P46939	3433 aa		31.13	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		31.13	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		31.13	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC4A2	P04920	1241 aa		31.12	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		31.12	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		31.12	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	NPHP1	O15259	732 aa		31.11	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	ST5	P78524	1137 aa		31.11	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	STK31	Q9BXU1	1019 aa		31.11	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF428	Q96B54	188 aa		31.1	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	NTSR2	O95665	410 aa		31.09	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	ERFE	Q4G0M1	354 aa		31.09	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		31.09	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	NLRP10	Q86W26	655 aa		31.09	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	PIM2	Q9P1W9	311 aa		31.09	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	ABCC12	Q96J65	1359 aa		31.08	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	PARP10	Q53GL7	1025 aa		31.08	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		31.08	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		31.08	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	BCS1L	Q9Y276	419 aa		31.08	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
TPCN1-222	ENST00000552897	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		31.07	■■■□□ 2.56
TPCN1-222	ENST00000552897	PDE6B	P35913	854 aa		31.07	■■■□□ 2.56
TPCN1-222	ENST00000552897	NYX	Q9GZU5	481 aa		31.07	■■■□□ 2.56
TPCN1-222	ENST00000552897		H0YIN7	160 aa		31.06	■■■□□ 2.56
TPCN1-222	ENST00000552897	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	31.06	■■■□□ 2.56
TPCN1-222	ENST00000552897	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	31.05	■■■□□ 2.56
TPCN1-222	ENST00000552897	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	31.05	■■■□□ 2.56
TPCN1-222	ENST00000552897	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		31.05	■■■□□ 2.56
TPCN1-222	ENST00000552897	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	31.04	■■■□□ 2.56
TPCN1-222	ENST00000552897	GRIN3B	O60391	1043 aa		31.04	■■■□□ 2.56
TPCN1-222	ENST00000552897	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		31.04	■■■□□ 2.56
TPCN1-222	ENST00000552897	SYNE4	Q8N205	404 aa		31.04	■■■□□ 2.56
TPCN1-222	ENST00000552897	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	31.04	■■■□□ 2.56
TPCN1-222	ENST00000552897	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		31.03	■■■□□ 2.56
TPCN1-222	ENST00000552897	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	31.03	■■■□□ 2.56
TPCN1-222	ENST00000552897	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	31.03	■■■□□ 2.56

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