RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549039.5

CTDSP2-205, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-205ENST00000549039 MASTLQ96GX5 879 aa16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2-205ENST00000549039 TAOK3Q9H2K8 898 aa16.12■□□□□ 0.17
CTDSP2-205ENST00000549039 SRGNP10124 158 aa16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2-205ENST00000549039 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2-205ENST00000549039 STYK1Q6J9G0 422 aa16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2-205ENST00000549039 CLEC4GQ6UXB4 293 aa16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2-205ENST00000549039 KLRG1Q96E93 195 aa16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2-205ENST00000549039 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2-205ENST00000549039 SCN7AQ01118 1682 aa16.11■□□□□ 0.17
CTDSP2-205ENST00000549039 TPTE2Q6XPS3 522 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-205ENST00000549039 NGEFQ8N5V2 710 aa16.1■□□□□ 0.17
CTDSP2-205ENST00000549039 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-205ENST00000549039 NBPF26B4DH59 902 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-205ENST00000549039 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-205ENST00000549039 SOGA3Q5TF21 947 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-205ENST00000549039 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-205ENST00000549039 NBPF15Q8N660 670 aa16.09■□□□□ 0.17
CTDSP2-205ENST00000549039 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-205ENST00000549039 DLEC1Q9Y238 1755 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDSP2-205ENST00000549039 SBF1O95248 1867 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 WDR90Q96KV7 1748 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 POTECB2RU33 542 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 DDNO94850 711 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 NPR1P16066 1061 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 CCDC93Q567U6 631 aa16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 PCNTO95613 3336 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 LTBP3Q9NS15 1303 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 HLFQ16534 295 aa16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 MYL6BP14649 208 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 KIF6Q6ZMV9 814 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 JMYQ8N9B5 988 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 TIAM2Q8IVF5 1701 aa16.04■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 OLFM4Q6UX06 510 aa16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 RGL2O15211 777 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 ALDH1B1P30837 517 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 NFE2L2Q16236 605 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 NUTM1Q86Y26 1132 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 PLEKHF1Q96S99 279 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 NYXQ9GZU5 481 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2-205ENST00000549039 BCORQ6W2J9 1755 aa16.02■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 IQCA1LA6NCM1 817 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 CHADLQ6NUI6 762 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 RTKN2Q8IZC4 609 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 C7orf43Q8WVR3 580 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 ZBTB3Q9H5J0 574 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 POTEIP0CG38 1075 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 POTEJP0CG39 1038 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 GPTP24298 496 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 TTLL7Q6ZT98 887 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 TSPYL4Q9UJ04 414 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 SLX4Q8IY92 1834 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 SYNE4Q8N205 404 aa15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 IARSP41252 1262 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 RIPK4P57078 832 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 ABCC12Q96J65 1359 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF541Q9H0D2 1346 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 SUSD4Q5VX71 490 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 LDHDQ86WU2 507 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 JDP2Q8WYK2 163 aa15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2-205ENST00000549039 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2-205ENST00000549039 CRY2Q49AN0 593 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2-205ENST00000549039 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2-205ENST00000549039 CREBZFQ9NS37 354 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2-205ENST00000549039 HACL1Q9UJ83 578 aa15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2-205ENST00000549039 UBN2Q6ZU65 1347 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-205ENST00000549039 CAPN15O75808 1086 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-205ENST00000549039 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-205ENST00000549039 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-205ENST00000549039 CACNA1SQ13698 1873 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-205ENST00000549039 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2-205ENST00000549039 EPHX2P34913 555 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2-205ENST00000549039 RALBP1Q15311 655 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2-205ENST00000549039 NEUROD2Q15784 382 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2-205ENST00000549039 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2-205ENST00000549039 TNS4Q8IZW8 715 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2-205ENST00000549039 NECTIN2Q92692 538 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms