RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-209ENST00000547052 GYS1P13807 737 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.92■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.92■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 VAMP4O75379 141 aa22.91■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.91■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 CAMTA2O94983 1202 aa22.9■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 ANXA1P04083 346 aa22.9■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 MMP10P09238 476 aa22.9■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 COPS6Q7L5N1 327 aa22.9■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 SETDB2Q96T68 719 aa22.9■■□□□ 1.26
BRF1-209ENST00000547052 SLC4A2P04920 1241 aa22.89■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 PDIA6Q15084 440 aa22.89■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 PROSER3Q2NL68 480 aa22.89■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.89■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.89■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 FKBP8Q14318 412 aa22.88■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.88■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.87■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.87■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 KLHL34Q8N239 644 aa22.87■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.86■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.86■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.85■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 ATP10DQ9P241 1426 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 PTGER2P43116 358 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 NYXQ9GZU5 481 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 NFIXQ14938 502 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-209ENST00000547052 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 ST5P78524 1137 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 FLIIQ13045 1269 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 PARP10Q53GL7 1025 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.81■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 CNBD1Q8NA66 436 aa22.81■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.81■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.81■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 SERPINB2P05120 415 aa22.8■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 TM4SF1P30408 202 aa22.8■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 KSR2Q6VAB6 950 aa22.8■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.8■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 HLFQ16534 295 aa22.79■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 PTPRCP08575 1304 aa22.79■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 KIF16BQ96L93 1317 aa22.79■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 GPTP24298 496 aa22.78■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 TCIRG1Q13488 830 aa22.78■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.78■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.77■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.77■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.77■■□□□ 1.24
BRF1-209ENST00000547052 MYH3P11055 1940 aa22.76■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.76■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 DDR1Q08345 913 aa22.76■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.76■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.76■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 FAM177BA6PVY3 158 aa22.75■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.75■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.75■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.74■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.74■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.74■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 MYD88Q99836 296 aa22.74■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.73■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 PDE6BP35913 854 aa22.73■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 G2E3Q7L622 706 aa22.73■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 LAMB2P55268 1798 aa22.73■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 CACNA1SQ13698 1873 aa22.73■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.72■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 TGFB2P61812 414 aa22.71■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.71■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 ADCY9O60503 1353 aa22.71■■□□□ 1.23
BRF1-209ENST00000547052 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.7■■□□□ 1.22
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