RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546215.5

SCARB1-211, Transcript of scavenger receptor class B member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB1, Length 1,597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB1-211ENST00000546215 STK31Q9BXU1 1019 aa26.72■■□□□ 1.87
SCARB1-211ENST00000546215 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.72■■□□□ 1.87
SCARB1-211ENST00000546215 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.71■■□□□ 1.87
SCARB1-211ENST00000546215 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SCARB1-211ENST00000546215 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.71■■□□□ 1.87
SCARB1-211ENST00000546215 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SCARB1-211ENST00000546215 RGL2O15211 777 aa26.71■■□□□ 1.87
SCARB1-211ENST00000546215 SLC4A2P04920 1241 aa26.71■■□□□ 1.87
SCARB1-211ENST00000546215 HLFQ16534 295 aa26.71■■□□□ 1.87
SCARB1-211ENST00000546215 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.71■■□□□ 1.87
SCARB1-211ENST00000546215 POLD1P28340 1107 aa26.7■■□□□ 1.86
SCARB1-211ENST00000546215 TM4SF1P30408 202 aa26.7■■□□□ 1.86
SCARB1-211ENST00000546215 LRP5O75197 1615 aa26.7■■□□□ 1.86
SCARB1-211ENST00000546215 CACNA1FO60840 1977 aa26.69■■□□□ 1.86
SCARB1-211ENST00000546215 MMP10P09238 476 aa26.69■■□□□ 1.86
SCARB1-211ENST00000546215 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.69■■□□□ 1.86
SCARB1-211ENST00000546215 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SCARB1-211ENST00000546215 NFIXQ14938 502 aa26.68■■□□□ 1.86
SCARB1-211ENST00000546215 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.67■■□□□ 1.86
SCARB1-211ENST00000546215 ZNF428Q96B54 188 aa26.67■■□□□ 1.86
SCARB1-211ENST00000546215 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.67■■□□□ 1.86
SCARB1-211ENST00000546215 G2E3Q7L622 706 aa26.67■■□□□ 1.86
SCARB1-211ENST00000546215 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SCARB1-211ENST00000546215 NUP98P52948 1817 aa26.66■■□□□ 1.86
SCARB1-211ENST00000546215 DDR1Q08345 913 aa26.66■■□□□ 1.86
SCARB1-211ENST00000546215 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SCARB1-211ENST00000546215 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.66■■□□□ 1.86
SCARB1-211ENST00000546215 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.64■■□□□ 1.86
SCARB1-211ENST00000546215 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.64■■□□□ 1.86
SCARB1-211ENST00000546215 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.63■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 FLIIQ13045 1269 aa26.63■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.63■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.62■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 SETDB2Q96T68 719 aa26.62■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 ATP10DQ9P241 1426 aa26.6■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.59■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.59■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.59■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 SERPINB2P05120 415 aa26.58■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 TCIRG1Q13488 830 aa26.58■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.58■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.58■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.58■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 KSR2Q6VAB6 950 aa26.58■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.58■■□□□ 1.85
SCARB1-211ENST00000546215 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.57■■□□□ 1.84
SCARB1-211ENST00000546215 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.57■■□□□ 1.84
SCARB1-211ENST00000546215 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SCARB1-211ENST00000546215 GPTP24298 496 aa26.57■■□□□ 1.84
SCARB1-211ENST00000546215 ADCY9O60503 1353 aa26.57■■□□□ 1.84
SCARB1-211ENST00000546215 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SCARB1-211ENST00000546215 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.56■■□□□ 1.84
SCARB1-211ENST00000546215 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.55■■□□□ 1.84
SCARB1-211ENST00000546215 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.55■■□□□ 1.84
SCARB1-211ENST00000546215 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.55■■□□□ 1.84
SCARB1-211ENST00000546215 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SCARB1-211ENST00000546215 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.54■■□□□ 1.84
SCARB1-211ENST00000546215 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SCARB1-211ENST00000546215 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SCARB1-211ENST00000546215 PARP10Q53GL7 1025 aa26.52■■□□□ 1.84
SCARB1-211ENST00000546215 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SCARB1-211ENST00000546215 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.51■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 SUSD4Q5VX71 490 aa26.51■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.51■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 NLRP10Q86W26 655 aa26.51■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 MYD88Q99836 296 aa26.51■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.51■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.51■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 FAM177BA6PVY3 158 aa26.5■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 CNBD1Q8NA66 436 aa26.5■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.5■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 KLHL34Q8N239 644 aa26.5■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.5■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 SYT17Q9BSW7 474 aa26.5■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 PTPRCP08575 1304 aa26.49■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.49■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 F6X3S4 739 aa26.49■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 BCAR3O75815 825 aa26.48■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 NTSR2O95665 410 aa26.48■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.48■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 NYXQ9GZU5 481 aa26.48■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 IGKV5-2P06315 115 aa26.47■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.47■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 NPHP1O15259 732 aa26.46■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.46■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.46■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.46■■□□□ 1.83
SCARB1-211ENST00000546215 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
SCARB1-211ENST00000546215 ST5P78524 1137 aa26.45■■□□□ 1.82
SCARB1-211ENST00000546215 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.45■■□□□ 1.82
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