RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 NYXQ9GZU5 481 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-215ENST00000544584 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-215ENST00000544584 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-215ENST00000544584 CARMIL3Q8ND23 1372 aa7.28□□□□□ -1.24
CLSTN3-215ENST00000544584 ERVV-1B6SEH8 477 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 A1BGP04217 495 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 SERPINB2P05120 415 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 TM4SF1P30408 202 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 CNBD1Q8NA66 436 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 MRS2Q9HD23 443 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 CREBZFQ9NS37 354 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 BCS1LQ9Y276 419 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 USP16Q9Y5T5 823 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 CNTNAP1P78357 1384 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 LBX1P52954 281 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 NFIXQ14938 502 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 CNKSR1Q969H4 720 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 AIDAQ96BJ3 306 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 CFAP44Q96MT7 982 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 TIAM2Q8IVF5 1701 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A0G2JLW4 131 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC85CA6NKD9 419 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 CHL1O00533 1208 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 PARP10Q53GL7 1025 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 TTLL6Q8N841 843 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 IFT57Q9NWB7 429 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 WBP1LQ9NX94 342 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 MIS18AQ9NYP9 233 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 APAF1O14727 1248 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNQ3O43525 872 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 CAMTA2O94983 1202 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 DDX58O95786 925 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 DPEP1P16444 411 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 ALDH1B1P30837 517 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC27Q2M243 656 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 SMIM5Q71RC9 77 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 C2CD5Q86YS7 1000 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 HYPKQ9NX55 129 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF181Q9P0P0 153 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 C4AP0C0L4 1744 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 MYL6BP14649 208 aa7.23□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 DDR1Q08345 913 aa7.23□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC30Q5VVM6 783 aa7.23□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 TBC1D9BQ66K14 1250 aa7.23□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 MASTLQ96GX5 879 aa7.23□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 STK31Q9BXU1 1019 aa7.23□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 UBR2Q8IWV8 1755 aa7.23□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 NPR1P16066 1061 aa7.22□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA2Q08379 1002 aa7.22□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 STYK1Q6J9G0 422 aa7.22□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.22□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 IL16Q14005 1332 aa7.22□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 TJP1Q07157 1748 aa7.21□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CLSTN3-215ENST00000544584 GLTPD2A6NH11 291 aa7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNA3P22001 575 aa7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 VEGFBP49765 207 aa7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 PRR5LQ6MZQ0 368 aa7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR63Q8IWG1 891 aa7.21□□□□□ -1.26
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