RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 NGLY1Q96IV0 654 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 BNIP3LO60238 219 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 ADAMTS2O95450 1211 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 WEE1P30291 646 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 ARID3AQ99856 593 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 IGF1RP08069 1367 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 FOXO3O43524 673 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 SLURP2P0DP57 97 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 FGFR3P22607 806 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 STK17AQ9UEE5 414 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 PRMT3O60678 531 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 BICRAQ9NZM4 1560 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 SVOPQ8N4V2 548 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-214ENST00000530727 FAM157BP0CG42 384 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 BMP4P12644 408 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 MAP2K3P46734 347 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 KLRG1Q96E93 195 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 TNP2Q05952 138 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 HIF1AQ16665 826 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 RTN1Q16799 776 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 SUSD3Q96L08 255 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 CD33P20138 364 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 WHAMMQ8TF30 809 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.316e-6■■■■■ 48.1
PTPRC-214ENST00000530727 CTBSQ01459 385 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 MAP3K10Q02779 954 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 OCLNQ16625 522 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 CEP63Q96MT8 703 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 MARK1Q9P0L2 795 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 C2CD2LO14523 706 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 EFSO43281 561 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 LAMC2Q13753 1193 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 ACDQ96AP0 544 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 BRD7Q9NPI1 651 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 DGKZQ13574 1117 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 FAM182BQ5T319 152 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 STRN4Q9NRL3 753 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 KLK14Q9P0G3 267 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 HCN2Q9UL51 889 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 BCRP11274 1271 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 TYRO3Q06418 890 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-214ENST00000530727 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 ATP2B4P23634 1241 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 MYO19Q96H55 970 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 IER5Q5VY09 327 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 ARAFP10398 606 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 SLAIN2Q9P270 581 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 GGA1Q9UJY5 639 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 BCS1LQ9Y276 419 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 ARHGEF15O94989 841 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 NEDD1Q8NHV4 660 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 COL26A1Q96A83 441 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-214ENST00000530727 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.82□□□□□ -1.32
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