RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 ANXA1P04083 346 aa21.43■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 TSPYL6Q8N831 410 aa21.43■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 MYL6BP14649 208 aa21.42■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.42■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.41■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 TM4SF1P30408 202 aa21.41■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 NFIXQ14938 502 aa21.41■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.4■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.4■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.4■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.39■■□□□ 1.02
HACE1-211ENST00000521962 HSPA6P17066 643 aa21.39■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.39■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 HLFQ16534 295 aa21.37■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.36■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.36■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 KIF3CO14782 793 aa21.35■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 RGL2O15211 777 aa21.35■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.35■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.35■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.34■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.34■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.34■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.34■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.34■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.33■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 GOLGA2Q08379 1002 aa21.33■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 COPS6Q7L5N1 327 aa21.33■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.33■■□□□ 1.01
HACE1-211ENST00000521962 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.32■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 SERPINB2P05120 415 aa21.31■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 SLFN5Q08AF3 891 aa21.31■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.31■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 NUP98P52948 1817 aa21.3■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 PCNTO95613 3336 aa21.3■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 E9PSI1 815 aa21.3■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 VAMP4O75379 141 aa21.3■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.29■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.29■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 HYPKQ9NX55 129 aa21.29■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.28■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 SETDB2Q96T68 719 aa21.28■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.28■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.27■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.27■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 TGFB2P61812 414 aa21.27■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.27■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.27■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.27■■□□□ 1
HACE1-211ENST00000521962 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.26■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 GPTP24298 496 aa21.25■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.25■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 G2E3Q7L622 706 aa21.24■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 CNBD1Q8NA66 436 aa21.24■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.24■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 ABCC12Q96J65 1359 aa21.23■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 A0A0G2JLW4 131 aa21.23■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 DPEP1P16444 411 aa21.23■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 KCNA3P22001 575 aa21.22■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.22■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 STK31Q9BXU1 1019 aa21.22■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.22■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 BCS1LQ9Y276 419 aa21.22■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 FAM177BA6PVY3 158 aa21.21■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 NTSR2O95665 410 aa21.21■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 SLC4A2P04920 1241 aa21.21■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 CHRNA5P30532 468 aa21.21■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 SUSD4Q5VX71 490 aa21.21■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.2■□□□□ 0.99
HACE1-211ENST00000521962 TOMM70O94826 608 aa21.2■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 TCIRG1Q13488 830 aa21.2■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 APLP1P51693 650 aa21.19■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 NLRP10Q86W26 655 aa21.19■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.19■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.19■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.19■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 WDR90Q96KV7 1748 aa21.18■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 FLIIQ13045 1269 aa21.18■□□□□ 0.98
HACE1-211ENST00000521962 PARP10Q53GL7 1025 aa21.18■□□□□ 0.98
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