RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.44■■□□□ 1.18
HERC3-211ENST00000513325 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
HERC3-211ENST00000513325 GLTPD2A6NH11 291 aa22.43■■□□□ 1.18
HERC3-211ENST00000513325 FSTL1Q12841 308 aa22.43■■□□□ 1.18
HERC3-211ENST00000513325 SRGNP10124 158 aa22.42■■□□□ 1.18
HERC3-211ENST00000513325 STYK1Q6J9G0 422 aa22.42■■□□□ 1.18
HERC3-211ENST00000513325 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.42■■□□□ 1.18
HERC3-211ENST00000513325 CNKSR1Q969H4 720 aa22.42■■□□□ 1.18
HERC3-211ENST00000513325 NFE2L2Q16236 605 aa22.41■■□□□ 1.18
HERC3-211ENST00000513325 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HERC3-211ENST00000513325 MASTLQ96GX5 879 aa22.41■■□□□ 1.18
HERC3-211ENST00000513325 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HERC3-211ENST00000513325 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
HERC3-211ENST00000513325 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.41■■□□□ 1.18
HERC3-211ENST00000513325 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.4■■□□□ 1.18
HERC3-211ENST00000513325 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
HERC3-211ENST00000513325 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 HLFQ16534 295 aa22.39■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.39■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 FAM177BA6PVY3 158 aa22.38■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 RGL2O15211 777 aa22.38■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 HTRA3P83110 453 aa22.38■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 ERFEQ4G0M1 354 aa22.38■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.38■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.38■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 SLX4Q8IY92 1834 aa22.38■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 NGEFQ8N5V2 710 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.36■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.36■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.36■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.36■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 WDR90Q96KV7 1748 aa22.36■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 SOGA3Q5TF21 947 aa22.35■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 CACNA1SQ13698 1873 aa22.34■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 NPR1P16066 1061 aa22.34■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 POTECB2RU33 542 aa22.33■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.33■■□□□ 1.17
HERC3-211ENST00000513325 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 RALBP1Q15311 655 aa22.32■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 IFFO2Q5TF58 517 aa22.32■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.32■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.32■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.31■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 MYL6BP14649 208 aa22.31■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 KLRG1Q96E93 195 aa22.31■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.31■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 RIPK4P57078 832 aa22.3■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 CCDC93Q567U6 631 aa22.3■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.3■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 OLFM4Q6UX06 510 aa22.29■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.29■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.28■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 NYXQ9GZU5 481 aa22.28■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.28■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 GPTP24298 496 aa22.27■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 ALDH1B1P30837 517 aa22.27■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HERC3-211ENST00000513325 ABCC12Q96J65 1359 aa22.26■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 NUP98P52948 1817 aa22.26■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.25■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 ERBB4Q15303 1308 aa22.25■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.25■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 CRY2Q49AN0 593 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 SUSD4Q5VX71 490 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.23■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 JMYQ8N9B5 988 aa22.23■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.22■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 PDIA6Q15084 440 aa22.22■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.22■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.22■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 POTEIP0CG38 1075 aa22.21■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 POTEJP0CG39 1038 aa22.21■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 NEUROD2Q15784 382 aa22.21■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.21■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 SYNE4Q8N205 404 aa22.21■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HERC3-211ENST00000513325 ANXA1P04083 346 aa22.2■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 PROSER3Q2NL68 480 aa22.2■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 CHADLQ6NUI6 762 aa22.2■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 NTSR2O95665 410 aa22.19■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HERC3-211ENST00000513325 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.19■■□□□ 1.14
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