RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511105.1

PTPN13-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, human

TSL 3

Gene PTPN13, Length 645 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN13-208	ENST00000511105	USP17L10	C9JJH3	530 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	USP17L12	C9JPN9	530 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	USP17L11	C9JVI0	530 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	USP17L21	D6R901	530 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	USP17L18	D6R9N7	530 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	USP17L22	D6RA61	530 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	USP17L19	D6RCP7	530 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	USP17L20	D6RJB6	530 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	7.27	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	USP17L24	Q0WX57	530 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	ADGRL1	O94910	1474 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	IL2RA	P01589	272 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	ERCC3	P19447	782 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	CNKSR1	Q969H4	720 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	FMN1	Q68DA7	1419 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	SSFA2	P28290	1259 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	CENPC	Q03188	943 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	ZNF592	Q92610	1267 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	UNCX	A6NJT0	531 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	SKI	P12755	728 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	CLN3	Q13286	438 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	GAS6	Q14393	721 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	RNF135	Q8IUD6	432 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	NBPF15	Q8N660	670 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	GPAM	Q9HCL2	828 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	SLAIN2	Q9P270	581 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	FANCA	O15360	1455 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	PTK7	Q13308	1070 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	SVOP	Q8N4V2	548 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	KIF14	Q15058	1648 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	PLCH2	O75038	1416 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	CEP162	Q5TB80	1403 aa		7.21	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		7.21	□□□□□ -1.25
PTPN13-208	ENST00000511105	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	ADAMTS2	O95450	1211 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	GNRH1	P01148	92 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	GPC1	P35052	558 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	HSPA2	P54652	639 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	NCOA4	Q13772	614 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	HECW1	Q76N89	1606 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	XAGE2	Q96GT9	111 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	NEO1	Q92859	1461 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	THBS1	P07996	1170 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	GSK3A	P49840	483 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	KCNMA1	Q12791	1236 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	USP4	Q13107	963 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PTPN13-208	ENST00000511105	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		7.19	□□□□□ -1.26

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