RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 ZBED9Q6R2W3 1325 aa34.51■■■■□ 3.11
SH3BP2-212ENST00000508338 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa34.51■■■■□ 3.11
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SH3BP2-212ENST00000508338 BCL2L12Q9HB09 334 aa34.5■■■■□ 3.11
SH3BP2-212ENST00000508338 VAMP4O75379 141 aa34.49■■■■□ 3.11
SH3BP2-212ENST00000508338 PROSER3Q2NL68 480 aa34.49■■■■□ 3.11
SH3BP2-212ENST00000508338 TM4SF1P30408 202 aa34.48■■■■□ 3.11
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF428Q96B54 188 aa34.47■■■■□ 3.11
SH3BP2-212ENST00000508338 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
SH3BP2-212ENST00000508338 COPS6Q7L5N1 327 aa34.46■■■■□ 3.11
SH3BP2-212ENST00000508338 CDCA7LQ96GN5 454 aa34.46■■■■□ 3.11
SH3BP2-212ENST00000508338 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa34.45■■■■□ 3.11
SH3BP2-212ENST00000508338 ANXA1P04083 346 aa34.45■■■■□ 3.11
SH3BP2-212ENST00000508338 TTLL7Q6ZT98 887 aa34.45■■■■□ 3.11
SH3BP2-212ENST00000508338 XAGE3Q8WTP9 111 aa34.45■■■■□ 3.11
SH3BP2-212ENST00000508338 NFIXQ14938 502 aa34.44■■■■□ 3.1
SH3BP2-212ENST00000508338 SETDB2Q96T68 719 aa34.44■■■■□ 3.1
SH3BP2-212ENST00000508338 NUP98P52948 1817 aa34.42■■■■□ 3.1
SH3BP2-212ENST00000508338 CARMIL3Q8ND23 1372 aa34.42■■■■□ 3.1
SH3BP2-212ENST00000508338 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
SH3BP2-212ENST00000508338 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa34.42■■■■□ 3.1
SH3BP2-212ENST00000508338 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
SH3BP2-212ENST00000508338 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
SH3BP2-212ENST00000508338 DDX58O95786 925 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
SH3BP2-212ENST00000508338 TBC1D9BQ66K14 1250 aa34.41■■■■□ 3.1
SH3BP2-212ENST00000508338 ATP10DQ9P241 1426 aa34.4■■■■□ 3.1
SH3BP2-212ENST00000508338 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa34.4■■■■□ 3.1
SH3BP2-212ENST00000508338 PLBD2Q8NHP8 589 aa34.4■■■■□ 3.1
SH3BP2-212ENST00000508338 ZBTB3Q9H5J0 574 aa34.4■■■■□ 3.1
SH3BP2-212ENST00000508338 CD2APQ9Y5K6 639 aa34.4■■■■□ 3.1
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC4A2P04920 1241 aa34.38■■■■□ 3.09
SH3BP2-212ENST00000508338 DDR1Q08345 913 aa34.38■■■■□ 3.09
SH3BP2-212ENST00000508338 HLFQ16534 295 aa34.37■■■■□ 3.09
SH3BP2-212ENST00000508338 BICDL1Q6ZP65 573 aa34.37■■■■□ 3.09
SH3BP2-212ENST00000508338 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP34.37■■■■□ 3.09
SH3BP2-212ENST00000508338 SERPINB2P05120 415 aa34.36■■■■□ 3.09
SH3BP2-212ENST00000508338 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
SH3BP2-212ENST00000508338 NRXN2Q9P2S2 1712 aa34.35■■■■□ 3.09
SH3BP2-212ENST00000508338 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
SH3BP2-212ENST00000508338 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
SH3BP2-212ENST00000508338 PARP10Q53GL7 1025 aa34.33■■■■□ 3.09
SH3BP2-212ENST00000508338 SYT17Q9BSW7 474 aa34.33■■■■□ 3.09
SH3BP2-212ENST00000508338 KIF13BQ9NQT8 1826 aa34.32■■■■□ 3.09
SH3BP2-212ENST00000508338 C10orf71Q711Q0 1435 aa34.32■■■■□ 3.08
SH3BP2-212ENST00000508338 RIC3Q7Z5B4 369 aa34.32■■■■□ 3.08
SH3BP2-212ENST00000508338 NYXQ9GZU5 481 aa34.32■■■■□ 3.08
SH3BP2-212ENST00000508338 TCIRG1Q13488 830 aa34.31■■■■□ 3.08
SH3BP2-212ENST00000508338 ALDH1L2Q3SY69 923 aa34.31■■■■□ 3.08
SH3BP2-212ENST00000508338 TPTE2Q6XPS3 522 aa34.31■■■■□ 3.08
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF34Q8IZ26 560 aa34.31■■■■□ 3.08
SH3BP2-212ENST00000508338 KLHL34Q8N239 644 aa34.31■■■■□ 3.08
SH3BP2-212ENST00000508338 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
SH3BP2-212ENST00000508338 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa34.31■■■■□ 3.08
SH3BP2-212ENST00000508338 NPHP1O15259 732 aa34.3■■■■□ 3.08
SH3BP2-212ENST00000508338 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
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SH3BP2-212ENST00000508338 CNBD1Q8NA66 436 aa34.29■■■■□ 3.08
SH3BP2-212ENST00000508338 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa34.28■■■■□ 3.08
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SH3BP2-212ENST00000508338 KSR2Q6VAB6 950 aa34.28■■■■□ 3.08
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa34.28■■■■□ 3.08
SH3BP2-212ENST00000508338 ST5P78524 1137 aa34.27■■■■□ 3.08
SH3BP2-212ENST00000508338 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa34.27■■■■□ 3.08
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF123Q5XPI4 1314 aa34.27■■■■□ 3.08
SH3BP2-212ENST00000508338 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
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SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
SH3BP2-212ENST00000508338 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
SH3BP2-212ENST00000508338 PRR5LQ6MZQ0 368 aa34.23■■■■□ 3.07
SH3BP2-212ENST00000508338 PI4KAP2A4QPH2 592 aa34.22■■■■□ 3.07
SH3BP2-212ENST00000508338 NEXNQ0ZGT2 675 aa34.22■■■■□ 3.07
SH3BP2-212ENST00000508338 G2E3Q7L622 706 aa34.22■■■■□ 3.07
SH3BP2-212ENST00000508338 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa34.22■■■■□ 3.07
SH3BP2-212ENST00000508338 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
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SH3BP2-212ENST00000508338 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa34.21■■■■□ 3.07
SH3BP2-212ENST00000508338 PDE6BP35913 854 aa34.2■■■■□ 3.07
SH3BP2-212ENST00000508338 NLRP10Q86W26 655 aa34.2■■■■□ 3.07
SH3BP2-212ENST00000508338 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
SH3BP2-212ENST00000508338 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
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SH3BP2-212ENST00000508338 PTPRCP08575 1304 aa34.19■■■■□ 3.06
SH3BP2-212ENST00000508338 ADCY9O60503 1353 aa34.19■■■■□ 3.06
SH3BP2-212ENST00000508338 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
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SH3BP2-212ENST00000508338 DCAF8L1A6NGE4 600 aa34.17■■■■□ 3.06
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC191Q8NCU4 936 aa34.17■■■■□ 3.06
SH3BP2-212ENST00000508338 RIC1Q4ADV7 1423 aa34.16■■■■□ 3.06
SH3BP2-212ENST00000508338 NTSR2O95665 410 aa34.16■■■■□ 3.06
SH3BP2-212ENST00000508338 NLGN2Q8NFZ4 835 aa34.16■■■■□ 3.06
SH3BP2-212ENST00000508338 DNAAF4Q8WXU2 420 aa34.16■■■■□ 3.06
SH3BP2-212ENST00000508338 MYD88Q99836 296 aa34.16■■■■□ 3.06
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM177BA6PVY3 158 aa34.15■■■■□ 3.06
SH3BP2-212ENST00000508338 PXDNLA1KZ92 1463 aa34.14■■■■□ 3.06
SH3BP2-212ENST00000508338 RARSP54136 660 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
SH3BP2-212ENST00000508338 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa34.13■■■■□ 3.05
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