RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	SCN7A	Q01118	1682 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	NBPF26	B4DH59	902 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	NBPF15	Q8N660	670 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	TTLL6	Q8N841	843 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	14.68	□□□□□ -0.06	7e-12	■□□□□ 9.6
TTLL3-231	ENST00000496246	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	CHRNA5	P30532	468 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	CNKSR1	Q969H4	720 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	SOGA3	Q5TF21	947 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM177B	A6PVY3	158 aa		14.65	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC27	Q2M243	656 aa		14.65	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	PARP10	Q53GL7	1025 aa		14.65	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		14.65	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	NECTIN2	Q92692	538 aa		14.65	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	14.65	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	MBIP	Q9NS73	344 aa		14.65	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		14.65	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		14.64	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	MASTL	Q96GX5	879 aa		14.64	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	HYPK	Q9NX55	129 aa		14.64	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	STYK1	Q6J9G0	422 aa		14.63	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		14.63	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNA3	P22001	575 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	ALDH1B1	P30837	517 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLGA2	Q08379	1002 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	HLF	Q16534	295 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	COPS6	Q7L5N1	327 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	STK31	Q9BXU1	1019 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP10D	Q9P241	1426 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	NPR1	P16066	1061 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	GPT	P24298	496 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC184	Q52MB2	194 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF853	P0CG23	659 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR63	Q8IWG1	891 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	WWC1	Q8IX03	1113 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	IL16	Q14005	1332 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	ANXA1	P04083	346 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	NLRP3	Q96P20	1036 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		14.58	□□□□□ -0.07
TTLL3-231	ENST00000496246	NUP98	P52948	1817 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	SRGN	P10124	158 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	PDIA6	Q15084	440 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT24	Q2M2I5	525 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF181	Q9P0P0	153 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	LMNB1	P20700	586 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	TCIRG1	Q13488	830 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	C21orf2	O43822	256 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	PROSER3	Q2NL68	480 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	ERFE	Q4G0M1	354 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC93	Q567U6	631 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
TTLL3-231	ENST00000496246	UTRN	P46939	3433 aa		14.56	□□□□□ -0.08

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