RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 SETDB2Q96T68 719 aa8.4□□□□□ -1.06
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CBX1-205ENST00000495350 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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CBX1-205ENST00000495350 EIF5P55010 431 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CBX1-205ENST00000495350 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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CBX1-205ENST00000495350 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
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CBX1-205ENST00000495350 RTKN2Q8IZC4 609 aa8.37□□□□□ -1.07
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CBX1-205ENST00000495350 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
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CBX1-205ENST00000495350 ZNF652Q9Y2D9 606 aa8.36□□□□□ -1.07
CBX1-205ENST00000495350 CACNA1SQ13698 1873 aa8.36□□□□□ -1.07
CBX1-205ENST00000495350 MAP2K2P36507 400 aa8.35□□□□□ -1.07
CBX1-205ENST00000495350 IARSP41252 1262 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
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CBX1-205ENST00000495350 HEG1Q9ULI3 1381 aa8.35□□□□□ -1.07
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CBX1-205ENST00000495350 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
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CBX1-205ENST00000495350 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.34□□□□□ -1.07
CBX1-205ENST00000495350 PANK3Q9H999 370 aa8.34□□□□□ -1.07
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CBX1-205ENST00000495350 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.33□□□□□ -1.08
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CBX1-205ENST00000495350 CST9Q5W186 159 aa8.3□□□□□ -1.08
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CBX1-205ENST00000495350 LTBP1Q14766 1721 aa8.29□□□□□ -1.08
CBX1-205ENST00000495350 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CBX1-205ENST00000495350 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CBX1-205ENST00000495350 NOGQ13253 232 aa8.29□□□□□ -1.08
CBX1-205ENST00000495350 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CBX1-205ENST00000495350 CIAPIN1Q6FI81 312 aa8.29□□□□□ -1.08
CBX1-205ENST00000495350 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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