RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492861.1

PKDCC-209, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 2

Gene PKDCC, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-209ENST00000492861 EXOC6Q8TAG9 804 aa15.55■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 ARXQ96QS3 562 aa15.55■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.55■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 DDX19BQ9UMR2 479 aa15.55■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 A1BGP04217 495 aa15.54■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.54■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 COG6Q9Y2V7 657 aa15.54■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 CCT4P50991 539 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 CCDC87Q9NVE4 849 aa15.53■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa15.53■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 MYL6BP14649 208 aa15.52■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 CRKLP46109 303 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 KSR2Q6VAB6 950 aa15.52■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 ITPRIPQ8IWB1 547 aa15.52■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.52■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 DNAAF4Q8WXU2 420 aa15.52■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 AKT1S1Q96B36 256 aa15.52■□□□□ 0.08
PKDCC-209ENST00000492861 PI4KAP2A4QPH2 592 aa15.51■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 F6X3S4 739 aa15.51■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 COPS6Q7L5N1 327 aa15.51■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa15.51■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 LINC00116Q8NCU8 138 aa15.51■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.51■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.51■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.51■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa15.51■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 C4BP0C0L5 1744 aa15.51■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa15.5■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 POLD1P28340 1107 aa15.49■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 EIF5P55010 431 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 BEND3Q5T5X7 828 aa15.49■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa15.49■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa15.49■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa15.49■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 RGL2O15211 777 aa15.48■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 KCNQ4P56696 695 aa15.48■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.47■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 BCORQ6W2J9 1755 aa15.47■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 ALDH1L1O75891 902 aa15.47■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 QSER1Q2KHR3 1735 aa15.47■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 SLC4A10Q6U841 1118 aa15.47■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.47■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.47■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 KLHL34Q8N239 644 aa15.47■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 LINS1Q8NG48 757 aa15.47■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa15.47■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.46■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 GPR162Q16538 588 aa15.46■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.46■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 SCN7AQ01118 1682 aa15.46■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 CHD4Q14839 1912 aa15.46■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa15.46■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 COL15A1P39059 1388 aa15.46■□□□□ 0.07
PKDCC-209ENST00000492861 A0A087WZG4 1122 aa15.45■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.45■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 NEXNQ0ZGT2 675 aa15.45■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 UBR3Q6ZT12 1888 aa15.44■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 RPS6KA4O75676 772 aa15.44■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 UTYO14607 1347 aa15.43■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa15.43■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 NEURL1BA8MQ27 555 aa15.43■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 IGKV5-2P06315 115 aa15.43■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 GNAI3P08754 354 aa15.43■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 NUP98P52948 1817 aa15.43■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 C4AP0C0L4 1744 aa15.43■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 MSH5O43196 834 aa15.42■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 ADRA2BP18089 450 aa15.42■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15.42■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 MEIS3Q99687 375 aa15.42■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 USP44Q9H0E7 712 aa15.42■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 COL24A1Q17RW2 1714 aa15.42■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 UTRNP46939 3433 aa15.41■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 GNPATO15228 680 aa15.41■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 CAMTA2O94983 1202 aa15.41■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 TCIRG1Q13488 830 aa15.41■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.41■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 AK7Q96M32 723 aa15.41■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 MYD88Q99836 296 aa15.41■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 ISCA1Q9BUE6 129 aa15.41■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.41■□□□□ 0.06
PKDCC-209ENST00000492861 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms