RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486229.5

NBPF3-212, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 3

Gene NBPF3, Length 933 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-212ENST00000486229 COPS6Q7L5N1 327 aa29.14■■■□□ 2.26
NBPF3-212ENST00000486229 MTFR1LQ9H019 292 aa29.14■■■□□ 2.26
NBPF3-212ENST00000486229 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.25
NBPF3-212ENST00000486229 XAGE3Q8WTP9 111 aa29.13■■■□□ 2.25
NBPF3-212ENST00000486229 ANXA1P04083 346 aa29.12■■■□□ 2.25
NBPF3-212ENST00000486229 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
NBPF3-212ENST00000486229 C1QTNF8P60827 252 aa29.12■■■□□ 2.25
NBPF3-212ENST00000486229 CLEC4GQ6UXB4 293 aa29.12■■■□□ 2.25
NBPF3-212ENST00000486229 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.12■■■□□ 2.25
NBPF3-212ENST00000486229 NLGN1Q8N2Q7 840 aa29.12■■■□□ 2.25
NBPF3-212ENST00000486229 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa29.12■■■□□ 2.25
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NBPF3-212ENST00000486229 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa29.11■■■□□ 2.25
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NBPF3-212ENST00000486229 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa29.11■■■□□ 2.25
NBPF3-212ENST00000486229 KIF16BQ96L93 1317 aa29.11■■■□□ 2.25
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NBPF3-212ENST00000486229 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa29.1■■■□□ 2.25
NBPF3-212ENST00000486229 PLBD2Q8NHP8 589 aa29.1■■■□□ 2.25
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NBPF3-212ENST00000486229 AMIGO3Q86WK7 504 aa29.09■■■□□ 2.25
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NBPF3-212ENST00000486229 BCORQ6W2J9 1755 aa29.08■■■□□ 2.25
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NBPF3-212ENST00000486229 RIC3Q7Z5B4 369 aa29.08■■■□□ 2.25
NBPF3-212ENST00000486229 CAMTA2O94983 1202 aa29.07■■■□□ 2.24
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NBPF3-212ENST00000486229 RCAN3Q9UKA8 241 aa29.06■■■□□ 2.24
NBPF3-212ENST00000486229 KSR2Q6VAB6 950 aa29.05■■■□□ 2.24
NBPF3-212ENST00000486229 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
NBPF3-212ENST00000486229 COL24A1Q17RW2 1714 aa29.05■■■□□ 2.24
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NBPF3-212ENST00000486229 NUP98P52948 1817 aa29.04■■■□□ 2.24
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NBPF3-212ENST00000486229 ZBTB3Q9H5J0 574 aa29.04■■■□□ 2.24
NBPF3-212ENST00000486229 NEXNQ0ZGT2 675 aa29.03■■■□□ 2.24
NBPF3-212ENST00000486229 SMIM5Q71RC9 77 aa29.03■■■□□ 2.24
NBPF3-212ENST00000486229 ARHGAP45Q92619 1136 aa29.03■■■□□ 2.24
NBPF3-212ENST00000486229 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.03■■■□□ 2.24
NBPF3-212ENST00000486229 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
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NBPF3-212ENST00000486229 POLD1P28340 1107 aa29.01■■■□□ 2.23
NBPF3-212ENST00000486229 G2E3Q7L622 706 aa29.01■■■□□ 2.23
NBPF3-212ENST00000486229 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
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NBPF3-212ENST00000486229 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.99■■■□□ 2.23
NBPF3-212ENST00000486229 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.99■■■□□ 2.23
NBPF3-212ENST00000486229 ATP10DQ9P241 1426 aa28.99■■■□□ 2.23
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NBPF3-212ENST00000486229 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.96■■■□□ 2.23
NBPF3-212ENST00000486229 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
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NBPF3-212ENST00000486229 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
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NBPF3-212ENST00000486229 ADCY9O60503 1353 aa28.94■■■□□ 2.22
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NBPF3-212ENST00000486229 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
NBPF3-212ENST00000486229 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.9■■■□□ 2.22
NBPF3-212ENST00000486229 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.9■■■□□ 2.22
NBPF3-212ENST00000486229 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
NBPF3-212ENST00000486229 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
NBPF3-212ENST00000486229 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.89■■■□□ 2.22
NBPF3-212ENST00000486229 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
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