RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
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RABGGTB-210ENST00000485459 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 ACDQ96AP0 544 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 ARXQ96QS3 562 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 CTBSQ01459 385 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 TNP2Q05952 138 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 KLRG1Q96E93 195 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.56□□□□□ -1.04
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RABGGTB-210ENST00000485459 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 IGFBP4P22692 258 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 C2CD2LO14523 706 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 ARHGEF15O94989 841 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 HIF1AQ16665 826 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 CEP63Q96MT8 703 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 MARK1Q9P0L2 795 aa8.53□□□□□ -1.04
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RABGGTB-210ENST00000485459 POTEAQ6S8J7 498 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 SUSD3Q96L08 255 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 GGA1Q9UJY5 639 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 AMPD1P23109 780 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 LAMC2Q13753 1193 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 PODNQ7Z5L7 613 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 STK32AQ8WU08 396 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 EFSO43281 561 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 FOXO3O43524 673 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 PRMT3O60678 531 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 ATG7O95352 703 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 ARAFP10398 606 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 WEE1P30291 646 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 RTN1Q16799 776 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM182BQ5T319 152 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 BRD7Q9NPI1 651 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 STRN4Q9NRL3 753 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 ADH6P28332 368 aa8.49□□□□□ -1.05
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RABGGTB-210ENST00000485459 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 RRAGCQ9HB90 399 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.056e-6■□□□□ 11
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RABGGTB-210ENST00000485459 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 HCN2Q9UL51 889 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 IRS1P35568 1242 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 NEUROD1Q13562 356 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-210ENST00000485459 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 TYRO3Q06418 890 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 KLK14Q9P0G3 267 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 EPXP11678 715 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 SPEM2Q0P670 501 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 DGKZQ13574 1117 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 SYT9Q86SS6 491 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNMA1Q12791 1236 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 GRIN2CQ14957 1233 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 RASSF7Q02833 373 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 IER5Q5VY09 327 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC30A3Q99726 388 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-210ENST00000485459 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.43□□□□□ -1.06
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