RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRVP-201ENST00000482597 ASAP1Q9ULH1 1129 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRVP-201ENST00000482597 GOLIM4O00461 696 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 RAD21O60216 631 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 DTNBO60941 627 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 TRDNQ13061 729 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 TTLL7Q6ZT98 887 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 TBC1D32Q96NH3 1257 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 PNPLA6Q8IY17 1366 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 DEPDC5O75140 1603 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 ZPR1O75312 459 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 TCEANC2Q96MN5 208 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 ALDH1L1O75891 902 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 CPLX1O14810 134 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 CYP27B1O15528 508 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 TIMM10P62072 90 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 SUCLG2Q96I99 432 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 NFXL1Q6ZNB6 911 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 ABCC4O15439 1325 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 CASTP20810 708 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 SIRT2Q8IXJ6 389 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP11.55□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 RICTORQ6R327 1708 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 PODXL2Q9NZ53 605 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 WWC3Q9ULE0 1092 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 TFCP2Q12800 502 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 LRP2BPQ9P2M1 347 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 IQGAP1P46940 1657 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 RTL1A6NKG5 1358 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 HIP1O00291 1037 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 NUCB2P80303 420 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 GCKRQ14397 625 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 RAI14Q9P0K7 980 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 PSMA5P28066 241 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 HAND2P61296 217 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF652Q9Y2D9 606 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 WDR17Q8IZU2 1322 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 BEND3Q5T5X7 828 aa11.52□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 BABAM1Q9NWV8 329 aa11.52□□□□□ -0.56
PTPRVP-201ENST00000482597 TRAK2O60296 914 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 FERMT3Q86UX7 667 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 DDX11Q96FC9 970 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 ANKARQ7Z5J8 1434 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 MYO3AQ8NEV4 1616 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 FIBPO43427 364 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP2B1P20020 1258 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 PDRG1Q9NUG6 133 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 HOXB7P09629 217 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 PLBD2Q8NHP8 589 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 LAMC1P11047 1609 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC83Q8IWF9 413 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 LRRC2Q9BYS8 371 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 CPA1P15085 419 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 RFC4P35249 363 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 AK7Q96M32 723 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 CARD10Q9BWT7 1032 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 USP21Q9UK80 565 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 C1orf167Q5SNV9 1468 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 NEURL1BA8MQ27 555 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 DBNDD2Q9BQY9 259 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 JAG2Q9Y219 1238 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 LRRC7Q96NW7 1537 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 DRC7Q8IY82 874 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRVP-201ENST00000482597 EVI5LQ96CN4 794 aa11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms