RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481331.1

ATXN2-208, Transcript of ataxin 2, human

TSL 3

Gene ATXN2, Length 381 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN2-208	ENST00000481331	TGFB2	P61812	414 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	KLHL34	Q8N239	644 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	DCTN1	Q14203	1278 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	GPR162	Q16538	588 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	TJP1	Q07157	1748 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	TM4SF1	P30408	202 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	SMIM5	Q71RC9	77 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	KCNQ3	O43525	872 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	MIER1	Q8N108	512 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	ERBB4	Q15303	1308 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	SEC24B	O95487	1268 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	USP16	Q9Y5T5	823 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	A1BG	P04217	495 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	YY1	P25490	414 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ATXN2-208	ENST00000481331	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	CHL1	O00533	1208 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	HOXB7	P09629	217 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	NFIX	Q14938	502 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	NEUROD2	Q15784	382 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	CFAP44	Q96MT7	982 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	SETDB2	Q96T68	719 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	C4A	P0C0L4	1744 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	CAMTA2	O94983	1202 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	SERPINB2	P05120	415 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	DDR1	Q08345	913 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	CCDC27	Q2M243	656 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	NGEF	Q8N5V2	710 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	MRS2	Q9HD23	443 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	NBPF26	B4DH59	902 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	APAF1	O14727	1248 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	PDE6B	P35913	854 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	GNAI1	P63096	354 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	NBPF15	Q8N660	670 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	IFT57	Q9NWB7	429 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	PIM2	Q9P1W9	311 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331		A0A0G2JLW4	131 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	ST18	O60284	1047 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	IFNL1	Q8IU54	200 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	UTRN	P46939	3433 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331		H0YIN7	160 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	NPHP1	O15259	732 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	ZNF853	P0CG23	659 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	DPEP1	P16444	411 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	NUBP1	P53384	320 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	ST5	P78524	1137 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	IER5L	Q5T953	404 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	CNBD1	Q8NA66	436 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ATXN2-208	ENST00000481331	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ATXN2-208	ENST00000481331	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ATXN2-208	ENST00000481331	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ATXN2-208	ENST00000481331	KCNA3	P22001	575 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ATXN2-208	ENST00000481331	NYX	Q9GZU5	481 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ATXN2-208	ENST00000481331	BCS1L	Q9Y276	419 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ATXN2-208	ENST00000481331	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ATXN2-208	ENST00000481331	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8

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