RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.53■■□□□ 1.68
ACTB-210ENST00000477812 GYS1P13807 737 aa25.53■■□□□ 1.68
ACTB-210ENST00000477812 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
ACTB-210ENST00000477812 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.53■■□□□ 1.68
ACTB-210ENST00000477812 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
ACTB-210ENST00000477812 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.52■■□□□ 1.68
ACTB-210ENST00000477812 BCAR3O75815 825 aa25.52■■□□□ 1.68
ACTB-210ENST00000477812 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.52■■□□□ 1.68
ACTB-210ENST00000477812 ADCY9O60503 1353 aa25.52■■□□□ 1.68
ACTB-210ENST00000477812 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.51■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 ZPR1O75312 459 aa25.51■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 HLFQ16534 295 aa25.51■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.51■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.51■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.51■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.51■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 MSH5O43196 834 aa25.5■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.5■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 ATP10DQ9P241 1426 aa25.49■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 FKBP8Q14318 412 aa25.49■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 ARXQ96QS3 562 aa25.49■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 NUP98P52948 1817 aa25.49■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 PTPRCP08575 1304 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 KIF16BQ96L93 1317 aa25.47■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 KSR2Q6VAB6 950 aa25.47■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.46■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.46■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 MTFR1LQ9H019 292 aa25.46■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.46■■□□□ 1.67
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB7AO95365 584 aa25.45■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.45■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.45■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.45■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.44■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 MSL1Q68DK7 614 aa25.44■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.44■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 TM4SF1P30408 202 aa25.43■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 NFIXQ14938 502 aa25.43■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.43■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 F6X3S4 739 aa25.42■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 TCIRG1Q13488 830 aa25.42■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.42■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.42■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.42■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.41■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 DDR1Q08345 913 aa25.41■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.41■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.4■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.4■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 TRIM27P14373 513 aa25.39■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 PTGER2P43116 358 aa25.39■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
ACTB-210ENST00000477812 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 IGKV5-2P06315 115 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 MMP10P09238 476 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 MYD88Q99836 296 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 ABCC4O15439 1325 aa25.37■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 GPTP24298 496 aa25.37■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 TNNQ9UQP3 1299 aa25.37■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.36■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 BEND3Q5T5X7 828 aa25.36■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.36■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.36■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 NLRP10Q86W26 655 aa25.36■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 SETDB2Q96T68 719 aa25.36■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 LINS1Q8NG48 757 aa25.35■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 PARP10Q53GL7 1025 aa25.34■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 SUSD4Q5VX71 490 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 SPON1Q9HCB6 807 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTB-210ENST00000477812 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.32■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.32■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.32■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.32■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 NTSR2O95665 410 aa25.31■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 PLIN1O60240 522 aa25.3■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 SERPINB2P05120 415 aa25.3■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 RLBP1P12271 317 aa25.3■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.3■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 LRP5O75197 1615 aa25.3■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 ALDH1L1O75891 902 aa25.29■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 POLD1P28340 1107 aa25.29■■□□□ 1.64
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